RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A0B4J269 797 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 A0A1W2PRG6 482 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MEIS2O14770 477 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LSM1O15116 133 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLITRK3O94933 977 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM107AO95990 144 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MYBL1P10243 752 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SLC2A3P11169 496 aa4.57□□□□□ -1.68
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ANKRD28-202ENST00000412318 STOML2Q9UJZ1 356 aa4.57□□□□□ -1.68
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ANKRD28-202ENST00000412318 MAP2K7O14733 419 aa4.56□□□□□ -1.68
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ANKRD28-202ENST00000412318 PMS2P54278 862 aa4.56□□□□□ -1.68
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ANKRD28-202ENST00000412318 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
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ANKRD28-202ENST00000412318 KRT77Q7Z794 578 aa4.56□□□□□ -1.68
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ANKRD28-202ENST00000412318 NT5DC4Q86YG4 428 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ADSSL1Q8N142 457 aa4.56□□□□□ -1.68
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ANKRD28-202ENST00000412318 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa4.56□□□□□ -1.68
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ANKRD28-202ENST00000412318 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.683e-7■■■■□ 25.1
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ANKRD28-202ENST00000412318 IP6K2Q9UHH9 426 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.56□□□□□ -1.683e-6■■■■■ 52.9
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ANKRD28-202ENST00000412318 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 SRGAP2O75044 1071 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CLTBP09497 229 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 OCM2P0CE71 109 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CXCL8P10145 99 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 MAPTP10636 758 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PDGFRAP16234 1089 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TMPRSS15P98073 1019 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 LGALS3BPQ08380 585 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 GIT2Q14161 759 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 AMHR2Q16671 573 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 HSDL1Q3SXM5 330 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 FBXW10Q5XX13 1052 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 TTC23LQ6PF05 361 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC36Q8IYA8 594 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 PDIK1LQ8N165 341 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.56□□□□□ -1.68
ANKRD28-202ENST00000412318 C3orf20Q8ND61 904 aa4.56□□□□□ -1.68
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