RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 SUMF1Q8NBK3 374 aa21.65■■□□□ 1.06
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UBE2E3-201ENST00000392415 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 NUDT5Q9UKK9 219 aa21.65■■□□□ 1.06
UBE2E3-201ENST00000392415 GREM1O60565 184 aa21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 IRF1P10914 325 aa21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 RALAP11233 206 aa21.64■■□□□ 1.05
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UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF132P52740 706 aa21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CNGA2Q16280 664 aa21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.64■■□□□ 1.05
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UBE2E3-201ENST00000392415 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 KREMEN1Q96MU8 473 aa21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.64■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 MDM4O15151 490 aa21.63■■□□□ 1.05
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UBE2E3-201ENST00000392415 ADH5P11766 374 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 STILQ15468 1287 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.63■■□□□ 1.05
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UBE2E3-201ENST00000392415 UBA3Q8TBC4 463 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 KCTD13Q8WZ19 329 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 GBP4Q96PP9 640 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ZSWIM1Q9BR11 485 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 EPC1Q9H2F5 836 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC4Q9HBW1 653 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CNTN6Q9UQ52 1028 aa21.63■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBED1O96006 694 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 GAD2Q05329 585 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC26Q8TAB7 109 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35F5Q8WV83 523 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ULBP1Q9BZM6 244 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 THAP9Q9H5L6 903 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 DACH1Q9UI36 760 aa21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 K7EQS6 105 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC6A11P48066 632 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.61■■□□□ 1.05
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UBE2E3-201ENST00000392415 BHLHA9Q7RTU4 235 aa21.61■■□□□ 1.05
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UBE2E3-201ENST00000392415 C12orf40Q86WS4 652 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa21.61■■□□□ 1.05
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UBE2E3-201ENST00000392415 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.61■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A0A0MRY4 1105 aa21.6■■□□□ 1.05
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UBE2E3-201ENST00000392415 HOXC13P31276 330 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 FNTBP49356 437 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 COG7P83436 770 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ADIGQ0VDE8 80 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM65Q6PJ69 517 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 GBP6Q6ZN66 633 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SYT13Q7L8C5 426 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM25Q86YD3 366 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SCML4Q8N228 414 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM81BQ96LP2 452 aa21.6■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 STC2O76061 302 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC9A1P19634 815 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CNR2P34972 360 aa21.59■■□□□ 1.05
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UBE2E3-201ENST00000392415 MESP2Q0VG99 397 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 EFEMP1Q12805 493 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 EXOC3L4Q17RC7 722 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 Q6ZNB5 142 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 MIB1Q86YT6 1006 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CAMKK1Q8N5S9 505 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 GPT2Q8TD30 523 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 RUBCNQ92622 972 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CNGB3Q9NQW8 809 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 RASAL2Q9UJF2 1139 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC8A2Q9UPR5 921 aa21.59■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 SPTBN4Q9H254 2564 aa21.58■■□□□ 1.05
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.58■■□□□ 1.05
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