RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 NMUR1Q9HB89 426 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF3Q9NR81 526 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 GKN1Q9NS71 199 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 SMPD4Q9NXE4 827 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 MYO6Q9UM54 1294 aa16.15■□□□□ 0.18
PGGT1B-202ENST00000379615 STK25O00506 426 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 MAN2B1O00754 1011 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 IFNAR2P48551 515 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 AMPD2Q01433 879 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 NHLH1Q02575 133 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 USP4Q13107 963 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF77Q15935 545 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 BSPRYQ5W0U4 402 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM110Q86TL2 294 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 MSANTD4Q8NCY6 345 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 MSANTD3Q96H12 275 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 LRRC3BQ96PB8 259 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 SYNCQ9H7C4 482 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCC13Q9NSE7 274 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 CFAP97Q9P2B7 532 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 TBC1D14Q9P2M4 693 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 CA14Q9ULX7 337 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa16.14■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 E2F8A0AVK6 867 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 FERP16591 822 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 PGFP49763 221 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 MRE11P49959 708 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 DAOAP59103 153 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 COG7P83436 770 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 NR1H3Q13133 447 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 PDCLQ13371 301 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 PASD1Q8IV76 773 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF214Q8ND24 703 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 OSCP1Q8WVF1 389 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP2A3Q93084 1043 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 NELL2Q99435 816 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 PHOX2BQ99453 314 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM83CQ9BQN1 747 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 OSER1Q9NX31 292 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 IFNKQ9P0W0 207 aa16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 E7ENQ6 273 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 TBX18O95935 607 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 CDR2Q01850 454 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 FIGNQ5HY92 759 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 IER5LQ5T953 404 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF3Q5VWG9 929 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF852Q6ZMS4 543 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 SCUBE3Q8IX30 993 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 CPA6Q8N4T0 437 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOC4Q96A65 974 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 OTUB2Q96DC9 234 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFYVE19Q96K21 471 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 MARCH2Q9P0N8 246 aa16.12■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 KRBA1A5PL33 1030 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 E5RJQ4 531 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ARNTLO00327 626 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 PIK3R2O00459 728 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 NFATC1O95644 943 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 LTFP02788 710 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 STARD6P59095 220 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ARID5AQ03989 594 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 EFEMP1Q12805 493 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 RUNX3Q13761 415 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 TPRG1Q6ZUI0 275 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 BEND5Q7L4P6 421 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ERICH1Q86X53 443 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 MIB1Q86YT6 1006 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXL6Q8N531 539 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 WDTC1Q8N5D0 677 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 FLCNQ8NFG4 579 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.11■□□□□ 0.17
PGGT1B-202ENST00000379615 DCLK3Q9C098 648 aa16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms