RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372904.7

TTPAL-202, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPAL, Length 6,234 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-202ENST00000372904 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ANO4Q32M45 955 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 XYLT1Q86Y38 959 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CRLF3Q8IUI8 442 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 FAM129AQ9BZQ8 928 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TYK2P29597 1187 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 BRCC3P46736 316 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PRELID2Q8N945 189 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 MYH7BA7E2Y1 1941 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 GOLGA8CPA6NN73 597 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 SEC24CP53992 1094 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PRAMEP78395 509 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PTK6Q13882 451 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TAPT1Q6NXT6 567 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 SLC4A11Q8NBS3 891 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TMEM169Q96HH4 297 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 YME1L1Q96TA2 773 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 FOXP3Q9BZS1 431 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 POPDC2Q9HBU9 364 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 HMGXB4Q9UGU5 601 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 DLEC1Q9Y238 1755 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 SEPT4O43236 478 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 LSP1P33241 339 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 RABGGTBP53611 331 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 POU5F1BQ06416 359 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 RPS6KA2Q15349 733 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 KLC3Q6P597 504 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ARHGAP24Q8N264 748 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 BORCS6Q96GS4 357 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TBCBQ99426 244 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa10.39□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 SLC12A8A0AV02 714 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PIGRP01833 764 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ASPHQ12797 758 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CPNE8Q86YQ8 564 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ANKRD52Q8NB46 1076 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PCDH9Q9HC56 1237 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 UBP1Q9NZI7 540 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CA12O43570 354 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 FDFT1P37268 417 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PIGZQ86VD9 579 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 NUDCD3Q8IVD9 361 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 SDHAF4Q5VUM1 108 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 SERPINB12Q96P63 405 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 FIZ1Q96SL8 496 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PADI3Q9ULW8 664 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 GIT1Q9Y2X7 761 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 LIASO43766 372 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PMPCBO75439 489 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 F9P00740 461 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CLCNKBP51801 687 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 MROH9Q5TGP6 573 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 LRRC52Q8N7C0 313 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 APOL2Q9BQE5 337 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TRIM55Q9BYV6 548 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TKTL2Q9H0I9 626 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 ABCF3Q9NUQ8 709 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 NOMO2Q5JPE7 1267 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 KDM7AQ6ZMT4 941 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 NETO2Q8NC67 525 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 AGR3Q8TD06 166 aa10.38□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PTPRJQ12913 1337 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 A0A1B0GUA9 196 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 FAM47DPA6NHR8 397 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 DPYSL4O14531 572 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PWWP2AQ96N64 755 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CCT8L2Q96SF2 557 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PSMD3O43242 534 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 BANF1O75531 89 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 POLBP06746 335 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TNFRSF8P28908 595 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 TAS2R42Q7RTR8 314 aa10.37□□□□□ -0.75
TTPAL-202ENST00000372904 RASGEF1CQ8N431 466 aa10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms