RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 CRB3Q9BUF7 120 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 IGSF9Q9P2J2 1179 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A087WV62 115 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 OR2W5A6NFC9 320 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 A8MVJ9 347 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 FFAR2O15552 330 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 C1QL1O75973 258 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE8BO95263 885 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT3O95989 172 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 FGAP02671 866 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 CREB1P16220 341 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 YY1P25490 414 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 MCM5P33992 734 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 CYP4F2P78329 520 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 PSG6Q00889 435 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFAIP2Q03169 654 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 MTAPQ13126 283 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 GRM1Q13255 1194 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP1A4Q13733 1029 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ACOX1Q15067 660 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 STRIP1Q5VSL9 837 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF527Q8NB42 609 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR24Q96S15 920 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM8AQ9HCN3 771 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 DTNAQ9Y4J8 743 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 F5H423 210 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 CBFA2T3O75081 653 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR47O94967 919 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV2-14P01704 120 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 GPD1P21695 349 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 FPR3P25089 353 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 DIO1P49895 249 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 DEUP1Q05D60 604 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ST3GAL2Q16842 350 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 CEP85Q6P2H3 762 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 PGBD2Q6P3X8 592 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 GGT6Q6P531 493 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF804AQ7Z570 1209 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 AMIGO2Q86SJ2 522 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 POF1BQ8WVV4 589 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 SARAFQ96BY9 339 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 GRAMD1AQ96CP6 724 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 MACROD1Q9BQ69 325 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ASAP1Q9ULH1 1129 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 TARM1B6A8C7 271 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 PIP5K1BO14986 540 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 JTBO76095 146 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 NTSR2O95665 410 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 VIPP01282 170 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 SRGAP2BP0DMP2 458 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM225BP0DP42 221 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 PBX1P40424 430 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 LMAN2Q12907 356 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 SFTPA1Q8IWL2 248 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 TERB1Q8NA31 727 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 REPS1Q96D71 796 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ZG16BQ96DA0 208 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS50Q96JG6 964 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 OBP2BQ9NPH6 170 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 CA14Q9ULX7 337 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-202ENST00000370826 NPC1O15118 1278 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 DHHO43323 396 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 CA12O43570 354 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 TMPRSS11DO60235 418 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOC3O60645 756 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PROP1O75360 226 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 GLP2RO95838 553 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ADRA1DP25100 572 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-202ENST00000370826 ELLP55199 621 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms