RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368102.5

SNHG28-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SNHG28, Length 2,501 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNHG28-201ENST00000368102 MZB1Q8WU39 189 aa14.62□□□□□ -0.07
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SNHG28-201ENST00000368102 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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