RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364007.1

RNU6-560P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 560, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-560P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-560P-201ENST00000364007 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 PTK2BQ14289 1009 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ACOX1Q15067 660 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 GRAMD1BQ3KR37 738 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ZACNQ401N2 412 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 PRR16Q569H4 304 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 PCID2Q5JVF3 399 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TSTD2Q5T7W7 516 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ANKRD16Q6P6B7 361 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 RASGRP3Q8IV61 690 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 SIRT6Q8N6T7 355 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 CHFRQ96EP1 664 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 MACROD1Q9BQ69 325 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 FSD1LQ9BXM9 530 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TMEM8AQ9HCN3 771 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ASB6Q9NWX5 421 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa5.01□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ZNF213O14771 459 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 PCDH17O14917 1159 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 DHHO43323 396 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 CA12O43570 354 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ASNA1O43681 348 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ORC4O43929 436 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 RHOBTB3O94955 611 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TJP3O95049 919 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 NTSR2O95665 410 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 VIPP01282 170 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 DLDP09622 509 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TMEM225BP0DP42 221 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 GYS1P13807 737 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 DRD4P21917 467 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 KLRK1P26718 216 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TGFB2P61812 414 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 GRM4Q14833 912 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 CLCA4Q14CN2 919 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TBC1D25Q3MII6 688 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TMEM196Q5HYL7 178 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 LCE5AQ5TCM9 118 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 NAPRTQ6XQN6 538 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 PTCHD4Q6ZW05 846 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ABHD11Q8NFV4 315 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 OR1N1Q8NGS0 311 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 CAGE1Q8TC20 777 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 FAM71BQ8TC56 605 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 MORC4Q8TE76 937 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 WDR24Q96S15 920 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 KLK15Q9H2R5 256 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 CPNE5Q9HCH3 593 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 LRFN1Q9P244 771 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 MGAT4CQ9UBM8 478 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TLK1Q9UKI8 766 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ADAM21Q9UKJ8 722 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 AMFRQ9UKV5 643 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TRIM38O00635 465 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 KIAA0355O15063 1070 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 DNPH1O43598 174 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TAF5LO75529 589 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 FGAP02671 866 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ANXA6P08133 673 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 NPSP0C0P6 89 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 NPPBP16860 134 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 SERPINF1P36955 418 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 DIO1P49895 249 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 CACNA2D1P54289 1103 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 CYP4F2P78329 520 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 BLMHQ13867 455 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 FAM153CQ494X1 144 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 MYCT1Q8N699 235 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 RMDN3Q96TC7 470 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 DUSP26Q9BV47 211 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 TRIM36Q9NQ86 728 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 DACT1Q9NYF0 836 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 A8MVJ9 347 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 SYT5O00445 386 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 ACKR2O00590 384 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 SUV39H1O43463 412 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 PIP5K1CO60331 668 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-560P-201ENST00000364007 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms