RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYCT1Q8N699 235 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIRT6Q8N6T7 355 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 STYXQ8WUJ0 223 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCT6BQ92526 530 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDYHV1Q96HA8 205 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 VPS50Q96JG6 964 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 PDLIM2Q96JY6 352 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 WDR24Q96S15 920 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 SNX15Q9NRS6 342 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUSP22Q9NRW4 184 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERTAD4Q9NUC0 356 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 DACT1Q9NYF0 836 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 DLL3Q9NYJ7 618 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXJ2Q9P0K8 574 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 SALL3Q9BXA9 1300 aa3.16□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 KAT6AQ92794 2004 aa3.15□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa3.15□□□□□ -1.9
RNU6-78P-201ENST00000362897 J3KTA2 159 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AP4M1O00189 453 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CYR61O00622 381 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MGST3O14880 152 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPRY2O43597 315 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMPRSS11DO60235 418 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 USP1O94782 785 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FSHBP01225 129 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITGA2BP08514 1039 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CREB1P16220 341 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKT1P31749 480 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SERPINF1P36955 418 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACVRL1P37023 503 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DGKQP52824 942 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ACOX1Q15067 660 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 P3H1Q32P28 736 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRR16Q569H4 304 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTCHD4Q6ZW05 846 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPATA5Q8NB90 893 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SUN3Q8TAQ9 357 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBC1D5Q92609 795 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 NUDT22Q9BRQ3 303 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 HERPUD2Q9BSE4 406 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 POLR3GLQ9BT43 218 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DUSP26Q9BV47 211 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FSD1LQ9BXM9 530 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYLK2Q9H1R3 596 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEH1Q9H213 219 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 EPS8L2Q9H6S3 715 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GRHPRQ9UBQ7 328 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AMFRQ9UKV5 643 aa3.15□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCHO1O14526 889 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CBFA2T3O75081 653 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 NTSR2O95665 410 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELFN1P0C7U0 828 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FPR3P25089 353 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ADRA1DP25100 572 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MCM5P33992 734 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PBX1P40424 430 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 HALP42357 657 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 GSTM5P46439 218 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RARRES1P49788 294 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPTQ07507 201 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 FOXO1Q12778 655 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTAPQ13126 283 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PRKG1Q13976 671 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CSHL1Q14406 222 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TBC1D25Q3MII6 688 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM196Q5HYL7 178 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 PCID2Q5JVF3 399 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 LIN54Q6MZP7 749 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 KLHL17Q6TDP4 642 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 NRSN1Q8IZ57 195 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 CAGE1Q8TC20 777 aa3.14□□□□□ -1.91
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms