RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 FITM2Q8N6M3 262 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 PITPNM3Q9BZ71 974 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 BCAT1P54687 386 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 BCAR1P56945 870 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 BNIP1Q12981 228 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 DPYSL2Q16555 572 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 XKR4Q5GH76 650 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 FBXO47Q5MNV8 452 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 NCAPGQ9BPX3 1015 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 RXFP1Q9HBX9 757 aa21.6■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 ZWINTO95229 277 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 AXLP30530 894 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 UBXN11Q5T124 520 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 ARCQ7LC44 396 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD52Q8NB46 1076 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 APOL6Q9BWW8 343 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 RAB6BQ9NRW1 208 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 GDAP2Q9NXN4 497 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 HEY1Q9Y5J3 304 aa21.59■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 EDF1O60869 148 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 LMO2P25791 158 aa21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 MSH2P43246 934 aa21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 SNX17Q15036 470 aa21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 SYCP2LQ5T4T6 812 aa21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF618Q5T7W0 954 aa21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 PHTF1Q9UMS5 762 aa21.58■■□□□ 1.05
KCNQ1-202ENST00000335475 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP3K6O95382 1288 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ZBED1O96006 694 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 CYP2F1P24903 491 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ADORA2BP29275 332 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 L1CAMP32004 1257 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SNX16P57768 344 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 MFSD10Q14728 455 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SPRYD7Q5W111 196 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ICE2Q659A1 982 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 LVRNQ6Q4G3 990 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF276Q8N554 614 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 BANPQ8N9N5 519 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC63Q8NA47 563 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 DNAJB3Q8WWF6 145 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC44A1Q8WWI5 657 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 CYTH2Q99418 400 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 CYLDQ9NQC7 956 aa21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 HAS3O00219 553 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 MGRN1O60291 552 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 AVILO75366 819 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 CD4P01730 458 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNE1P15382 129 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 OLFML2BQ68BL8 750 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 C7orf31Q8N865 590 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 RNF39Q9H2S5 420 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 PLAC1Q9HBJ0 212 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ETNK2Q9NVF9 386 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 KLK14Q9P0G3 267 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHL14Q9P2G3 628 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TTLL3Q9Y4R7 772 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 CFAP73A6NFT4 308 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 KPNA7A9QM74 516 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SPAG6O75602 509 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 PDGFRBP09619 1106 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TKTP29401 623 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC15Q0P6D6 951 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 IRF5Q13568 498 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 MORN1Q5T089 497 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 FAXCQ5TGI0 409 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 TLK2Q86UE8 772 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 LRRN4Q8WUT4 740 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF560Q96MR9 790 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ECT2Q9H8V3 914 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 POPDC2Q9HBU9 364 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 FLRT1Q9NZU1 646 aa21.57■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 DESP17661 470 aa21.56■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 ADRA1DP25100 572 aa21.56■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.56■■□□□ 1.04
KCNQ1-202ENST00000335475 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 203.8 ms