RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ETNK2Q9NVF9 386 aa23.43■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 FCHO1O14526 889 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 PFKMP08237 780 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 RARBP10826 455 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 MYL2P10916 166 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 AMHR2Q16671 573 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 KYAT1Q16773 422 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC14Q49A88 953 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 RAB6CQ53S08 254 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 PPM1NQ8N819 430 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 UBA3Q8TBC4 463 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 HPDLQ96IR7 371 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF670Q9BS34 389 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 RAB6CQ9H0N0 254 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 PCDH18Q9HCL0 1135 aa23.42■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 MDM4O15151 490 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 RFPL1O75677 317 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ZBED1O96006 694 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 NEFHP12036 1026 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 PHKA2P46019 1235 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 CLCN3P51790 818 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 BCAR1P56945 870 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 OR6B2Q6IFH4 312 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 IFT122Q9HBG6 1241 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 TAS2R1Q9NYW7 299 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ITGA11Q9UKX5 1188 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 I3L4J1 428 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 C22orf31O95567 290 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 APOEP02649 317 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 RBL1P28749 1068 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 NDST1P52848 882 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ATG16L1Q676U5 607 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM130Q8N3G9 435 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 PCDH19Q8TAB3 1148 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA33Q96N06 139 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 PDZD7Q9H5P4 517 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGEF4Q9NR80 690 aa23.41■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 H0Y3Z8 333 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXD1-201ENST00000331462 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
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HOXD1-201ENST00000331462 TEX44Q53QW1 395 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXD1-201ENST00000331462 RINLQ6ZS11 566 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 CTAGE3PQ8IX95 158 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 LMNTD2Q8IXW0 634 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC9Q8WXX5 260 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 GGA3Q9NZ52 723 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 C2CD2Q9Y426 696 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 FAM159BA6NKW6 160 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 CAPN14A8MX76 684 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 KRT38O76015 456 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 TOMM70O94826 608 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 TPSB2P20231 275 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 VHLP40337 213 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 TPSAB1Q15661 275 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ACSBG2Q5FVE4 666 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ANO7Q6IWH7 933 aa23.4■■□□□ 1.34
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HOXD1-201ENST00000331462 MCUR1Q96AQ8 359 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 NMUR2Q9GZQ4 415 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 SMYD2Q9NRG4 433 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 ZFATQ9P243 1243 aa23.4■■□□□ 1.34
HOXD1-201ENST00000331462 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa23.39■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 SETSIPP0DME0 302 aa23.39■■□□□ 1.33
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HOXD1-201ENST00000331462 BST1Q10588 318 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 VGLL4Q14135 290 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 DBN1Q16643 649 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 PKDCCQ504Y2 493 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 UNC5AQ6ZN44 842 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 TTC7BQ86TV6 843 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 VPS52Q8N1B4 723 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP24Q8N264 748 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF333Q96JL9 665 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 NT5C1AQ9BXI3 368 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa23.39■■□□□ 1.33
HOXD1-201ENST00000331462 BIRC5O15392 142 aa23.38■■□□□ 1.33
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