RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 PER2O15055 1255 aa23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SSR1P43307 286 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 PTPN9P43378 593 aa23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 BTBD8Q5XKL5 378 aa23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 HES6Q96HZ4 224 aa23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 SLITRK1Q96PX8 696 aa23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 NMUR1Q9HB89 426 aa23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 ABCC13Q9NSE7 274 aa23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 STAP1Q9ULZ2 295 aa23.15■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa23.14■■□□□ 1.3
CTU2-201ENST00000312060 A0A1W2PQH9 124 aa23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 LRG1P02750 347 aa23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PGFP49763 221 aa23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 DNA2P51530 1060 aa23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 SLC25A52Q3SY17 297 aa23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 BEND5Q7L4P6 421 aa23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 CD101Q93033 1021 aa23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 DOCK6Q96HP0 2047 aa23.14■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 LRCH4O75427 683 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 LRIT3Q3SXY7 679 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 ITIH5Q86UX2 942 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 SLC22A17Q8WUG5 538 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PSMG2Q969U7 264 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 MYRFLQ96LU7 910 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 MAN1C1Q9NR34 630 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 ASB3Q9Y575 518 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 DENND4CQ5VZ89 1909 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 TRANK1O15050 2925 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 A0A1W2PPC1 479 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 EPCAMP16422 314 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PSEN1P49768 467 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 SULT1E1P49888 294 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PPM1LQ5SGD2 360 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 RTL10Q7L3V2 364 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 FAM172AQ8WUF8 416 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 NT5C3BQ969T7 300 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 TBCBQ99426 244 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PSMB7Q99436 277 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 NPY6RQ99463 290 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 NCAPGQ9BPX3 1015 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 ZNF576Q9H609 170 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 TLE6Q9H808 572 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 OSER1Q9NX31 292 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 RRN3Q9NYV6 651 aa23.13■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 CCDC66A2RUB6 948 aa23.12■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 TAS2R40P59535 323 aa23.12■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.12■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 KRT35Q92764 455 aa23.12■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 SNX12Q9UMY4 172 aa23.12■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa23.12■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa23.12■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 SAR1BQ9Y6B6 198 aa23.12■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 OBSL1O75147 1896 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 M0QYT0 321 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 TCF4P15884 667 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 CTNNA2P26232 953 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PCK1P35558 622 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
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CTU2-201ENST00000312060 RHOT1Q8IXI2 618 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PDZD8Q8NEN9 1154 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 RNF139Q8WU17 664 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 HDAC7Q8WUI4 952 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 OVCA2Q8WZ82 227 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 ADAM33Q9BZ11 813 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 CLIC5Q9NZA1 410 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 DPP7Q9UHL4 492 aa23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 ZMYND10O75800 440 aa23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 MIPP30301 263 aa23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 HDAC4P56524 1084 aa23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 DUSP6Q16828 381 aa23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 RAB6CQ53S08 254 aa23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 ELMOD1Q8N336 334 aa23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 OSBPL9Q96SU4 736 aa23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 RAB6CQ9H0N0 254 aa23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 PCSK1NQ9UHG2 260 aa23.1■■□□□ 1.29
CTU2-201ENST00000312060 USP18Q9UMW8 372 aa23.1■■□□□ 1.29
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