RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308478.9

LRRN3-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,099 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-201ENST00000308478 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.53□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.53□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
LRRN3-201ENST00000308478 MYPNQ86TC9 1320 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PAPPAQ13219 1627 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 BIRC5O15392 142 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UGT1A9O60656 530 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 GAS7O60861 476 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ABCB7O75027 752 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ADAM23O75077 832 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 IL1BP01584 269 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ITGAVP06756 1048 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 CYP3A4P08684 503 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PAX3P23760 479 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 NUP107P57740 925 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 AP3B2Q13367 1082 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ITGA7Q13683 1181 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 FLOT2Q14254 428 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 LGSNQ5TDP6 509 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 KRT80Q6KB66 452 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 OGFOD2Q6N063 350 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 C16orf46Q6P387 395 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 BORAQ6PGQ7 559 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 DDHD1Q8NEL9 900 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 NLRP7Q8WX94 980 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 HSPH1Q92598 858 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PPME1Q9Y570 386 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UBE4BO95155 1302 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SLC16A4O15374 487 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 CST8O60676 142 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 BPGMP07738 259 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PHKA2P46019 1235 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 CDH15P55291 814 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 IGBP1P78318 339 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 APOFQ13790 326 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ADRM1Q16186 407 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TEX44Q53QW1 395 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 KCNT1Q5JUK3 1230 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PDPK2PQ6A1A2 396 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PADI6Q6TGC4 694 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 CPNE9Q8IYJ1 553 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 DAW1Q8N136 415 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PNPOQ9NVS9 261 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 EBF1Q9UH73 591 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ITGA11Q9UKX5 1188 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SORCS3Q9UPU3 1222 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 LAMB2P55268 1798 aa6.52□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 KLHL41O60662 606 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 DGKIO75912 1065 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 FBXO21O94952 628 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SREBF1P36956 1147 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SLC1A6P48664 564 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 NOVP48745 357 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 NUDT2P50583 147 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PKNOX1P55347 436 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PEX3P56589 373 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 C21orf59P57076 290 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 PFKPQ01813 784 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 C6orf183Q5T699 404 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 XKR5Q6UX68 686 aa6.51□□□□□ -1.37
LRRN3-201ENST00000308478 SV2AQ7L0J3 742 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms