RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 PON2Q15165 354 aa26.4■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 PM20D1Q6GTS8 502 aa26.4■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 DENND1BQ6P3S1 775 aa26.4■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 BPIFA3Q9BQP9 254 aa26.4■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 E2F8A0AVK6 867 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 SMTNL1A8MU46 457 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 PTPN5P54829 565 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 BTBD8Q5XKL5 378 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 KLHDC10Q6PID8 442 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 MIB1Q86YT6 1006 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 KIAA1958Q8N8K9 716 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 CNGB3Q9NQW8 809 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 ST7Q9NRC1 585 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 TBC1D14Q9P2M4 693 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 RASAL2Q9UJF2 1139 aa26.39■■□□□ 1.82
PDF-201ENST00000288022 UCHL3P15374 230 aa26.38■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 ZNF18P17022 549 aa26.38■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 MAGEA9P43362 315 aa26.38■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 ZNF165P49910 485 aa26.38■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 EFEMP1Q12805 493 aa26.38■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 CLDN23Q96B33 292 aa26.38■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 HSFY1Q96LI6 401 aa26.38■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 LMAN1LQ9HAT1 526 aa26.38■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 GJA4P35212 333 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 GPD2P43304 727 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 KLK7P49862 253 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 DAOAP59103 153 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 TCF15Q12870 199 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 LRRC32Q14392 662 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 SMYD5Q6GMV2 418 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 ZNF276Q8N554 614 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 WBP2Q969T9 261 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 MIS12Q9H081 205 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 HSD3B7Q9H2F3 369 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 PLCB1Q9NQ66 1216 aa26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 YJEFN3A6XGL0 299 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 LGALS16A8MUM7 142 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 E7ENQ6 273 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 H0Y858 1186 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 ATP1A3P13637 1013 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 RPS9P46781 194 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 UBXN1Q04323 297 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 FZD5Q13467 585 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 MEA1Q16626 185 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 BHLHA9Q7RTU4 235 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 FAM71AQ8IYT1 594 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 ZNF687Q8N1G0 1237 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 RNF139Q8WU17 664 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 EXOC4Q96A65 974 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 STRIP2Q9ULQ0 834 aa26.36■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 GABBR2O75899 941 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 FBXO21O94952 628 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 CYP17A1P05093 508 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 CHRNB1P11230 501 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 CLCN1P35523 988 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 KRT9P35527 623 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 BPIFB4P59827 614 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 ANGPT1Q15389 498 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 SYCP1Q15431 976 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 BSPRYQ5W0U4 402 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 SLC47A2Q86VL8 602 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 PASD1Q8IV76 773 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 BBS7Q8IWZ6 715 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 SCML4Q8N228 414 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 EDEM1Q92611 657 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 GOLGA1Q92805 767 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 OTUB2Q96DC9 234 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 GANQ9H2C0 597 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 MARCH2Q9P0N8 246 aa26.35■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 HMBSP08397 361 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 ACADSBP45954 432 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 COG7P83436 770 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 DHCR24Q15392 516 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 DGKKQ5KSL6 1271 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 C1orf210Q8IVY1 113 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 CLEC4CQ8WTT0 213 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 IRGQQ8WZA9 623 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 CHFRQ96EP1 664 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 P2RY13Q9BPV8 354 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 STK33Q9BYT3 514 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 ABCC13Q9NSE7 274 aa26.34■■□□□ 1.81
PDF-201ENST00000288022 LRRC10BA6NIK2 292 aa26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms