RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM25Q86YD3 366 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 SFTPA1Q8IWL2 248 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TWNKQ96RR1 684 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 MMRN2Q9H8L6 949 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CYLDQ9NQC7 956 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 THADAQ6YHU6 1953 aa22.23■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TM4SF5O14894 197 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CILPO75339 1184 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TULP3O75386 442 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TBX18O95935 607 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 PGFP49763 221 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 RNF43Q68DV7 783 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 KRT39Q6A163 491 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 PHTF2Q8N3S3 785 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 WBP2Q969T9 261 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 FAXDC2Q96IV6 333 aa22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TPRP12270 2363 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 HHLA1C9JL84 531 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CD58P19256 250 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 KLHDC10Q6PID8 442 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 TTC39CQ8N584 583 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 WHAMMQ8TF30 809 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 WDR35Q9P2L0 1181 aa22.21■■□□□ 1.15
NEDD8-201ENST00000250495 NUP205Q92621 2012 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 STX10O60499 249 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 RARGP13631 454 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 KCNA4P22459 653 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 PLA2G4AP47712 749 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 PSEN1P49768 467 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 PGBD3Q8N328 593 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 SPACA7Q96KW9 195 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 DUSP16Q9BY84 665 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 OSER1Q9NX31 292 aa22.2■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 CETN3O15182 167 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 CYP26A1O43174 497 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 MAP3K13O43283 966 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 GREM1O60565 184 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 ADAM23O75077 832 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 BCKDHBP21953 392 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 P2RY2P41231 377 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 KIF11P52732 1056 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF276Q8N554 614 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 TERB1Q8NA31 727 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 TCEAL3Q969E4 200 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 NMUR1Q9HB89 426 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 DNMT3LQ9UJW3 386 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 STARD13Q9Y3M8 1113 aa22.19■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 A0A1W2PQH9 124 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 C10orf76Q5T2E6 689 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 LPCAT2Q7L5N7 544 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC186Q7Z3E2 898 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 CYP2U1Q7Z449 544 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 HMGB4Q8WW32 186 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 EDEM2Q9BV94 578 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 BBS2Q9BXC9 721 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 RMND1Q9NWS8 449 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 RAB20Q9NX57 234 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 MARK1Q9P0L2 795 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 NAGPAQ9UK23 515 aa22.18■■□□□ 1.14
NEDD8-201ENST00000250495 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms