RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000023154.2

Cldn1-201, Transcript of Claudin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cldn1, Length 3,247 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Tight Junction .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem220Q8BP07 167 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmem209Q8BRG8 561 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Phactr3Q8BYK5 558 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 CgasQ8C6L5 507 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Phtf2Q8CB19 747 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 St13Q99L47 371 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Clec4aQ9QZ15 238 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cep350E9Q309 3095 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 DgkdE9PUQ8 1220 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mup13L7N222 235 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ptpn9O35239 593 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc27a2O35488 620 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Dmp1O55188 503 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 CtswP56203 371 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 InscQ3HNM7 579 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rnf180Q3U827 592 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm14685Q52KH6 695 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PkdccQ5RJI4 492 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Phlda1Q62392 405 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 OcrlQ6NVF0 900 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Xpo1Q6P5F9 1071 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rad9bQ6WBX7 403 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PhkbQ7TSH2 1085 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zswim5Q80TC6 1188 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Q810S2 196 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Btbd9Q8C726 612 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Dnm1lQ8K1M6 742 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sbk1Q8QZX0 417 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Haus3Q8QZX2 570 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 4930550L24RikQ99PA7 320 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PmpcbQ9CXT8 489 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slc25a19Q9DAM5 318 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tsc1Q9EP53 1161 aa9.49□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fam171a2A2A699 822 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm16430A6X8J1 155 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 C87414E9PWI7 475 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm3138K7N754 218 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pias1O88907 651 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Hoxb8P09632 243 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Sept4P28661 478 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Nos2P29477 1144 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 BtkP35991 659 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 SftpbP50405 377 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 SiaeP70665 541 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Faf2Q3TDN2 445 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Echdc2Q3TLP5 296 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Vps51Q3UVL4 782 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ndrg1Q62433 394 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cyp2c29Q64458 490 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rbl2Q64700 1135 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Adam39Q7M762 756 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zdhhc17Q80TN5 632 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 CyldQ80TQ2 952 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Lig4Q8BTF7 911 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Lrrc66Q8K0B3 872 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr1494Q8VGP8 315 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Olfr532Q8VGT4 309 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Rin1Q921Q7 763 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Slxl1Q9D515 155 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Prss23Q9D6X6 382 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Magel2Q9QZ04 1284 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Col5a3Q9JLI2 1739 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ces1bD3Z5G7 567 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 AlbP07724 608 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 FynP39688 537 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Abl2Q4JIM5 1182 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Xlr3bQ6P205 226 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Uts2bQ765I1 113 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tmc8Q7TN58 722 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Ankrd45Q810N6 248 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cdkn3Q810P3 211 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 NfascQ810U3 1240 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Chmp2bQ8BJF9 213 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fam78aQ8C552 283 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pih1h3bQ8C6P5 218 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Zmiz2Q8CIE2 920 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Prpf39Q8K2Z2 665 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ItpkaQ8R071 459 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fam114a2Q8VE88 497 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Usp3Q91W36 520 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Adi1Q99JT9 179 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Usp11Q99K46 921 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Leng1Q9DB98 261 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Dcaf6Q9DC22 876 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 PigoQ9JJI6 1093 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Tspan3Q9QY33 253 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fpr-rs4A4FUQ5 323 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Cyp2t4E9PWV0 503 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Prpmp5E9PXN1 296 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Gm6205E9PZS2 359 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Mroh4G3X8W1 983 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Serpinb6eI7HJI3 429 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 AgxtO35423 414 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Diaph2O70566 1098 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 ShdO88834 343 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Shox2P70390 331 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Lig3P97386 1015 aa9.48□□□□□ -0.89
Cldn1-201ENSMUST00000023154 Fmo3P97501 534 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 37.4 ms