RNA–Protein interactions for RNA: YLR318W

EST2, Transcript of Reverse transcriptase subunit of the telomerase holoenzyme, yeast

Gene EST2, Length 2,655 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST2	YLR318W	YMR001C-A	Q8TGS9	76 aa		0.51	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	COX9	P07255	59 aa		0.51	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	OLI1	P61829	76 aa		0.51	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	TOS6	P48560	102 aa		0.5	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	YFR009W-A	P0C5M9	85 aa		0.5	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	YBL044W	P38194	122 aa		0.5	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	RPS29B	P41058	56 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		0.49	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		0.49	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		0.49	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		0.48	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	YBR230W-A	Q3E762	66 aa		0.48	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	YPR117W	Q06116	2489 aa		0.47	□□□□□ -2.33
EST2	YLR318W	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	RPS27B	P38711	82 aa		0.46	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		0.45	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.45	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	RPL29	P05747	59 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	COA2	Q3E823	68 aa		0.44	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	TAO3	P40468	2376 aa		0.44	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	YOR008C-A	Q3E7B9	74 aa		0.43	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	DDR2	P89113	61 aa		0.43	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	YDR524C-B	Q3E6R4	66 aa		0.43	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	YGL258W-A	Q3E740	77 aa		0.43	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	SIP18	P50263	79 aa		0.42	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	HOR7	Q05827	59 aa		0.41	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	YGR146C-A	Q8TGT9	53 aa		0.41	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	YOR316C-A	Q3E806	69 aa		0.41	□□□□□ -2.34
EST2	YLR318W	YHR073W-A	P0C5N7	58 aa		0.4	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	YJL133C-A	Q3E7A3	74 aa		0.4	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	YLL006W-A	Q3E814	58 aa		0.4	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	YCR108C	Q3E819	63 aa		0.4	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	TOM7	P53507	60 aa		0.39	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	YJL127C-B	Q3E828	52 aa		0.38	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	YOR072W-B	Q3E832	53 aa		0.38	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	PMP3	P87284	55 aa		0.38	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	NCE101	Q02820	53 aa		0.37	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	RPS29A	P41057	56 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	YDR034C-A	P0C289	58 aa		0.34	□□□□□ -2.35
EST2	YLR318W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
EST2	YLR318W	YML054C-A	Q3E809	52 aa		0.32	□□□□□ -2.36
EST2	YLR318W	TOR1	P35169	2470 aa		0.31	□□□□□ -2.36
EST2	YLR318W	DYN1	P36022	4092 aa		0.31	□□□□□ -2.36
EST2	YLR318W	YHR050W-A	Q05451	56 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EST2	YLR318W	YMR105W-A	Q8TGS8	64 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EST2	YLR318W	Q0017	Q9ZZX8	53 aa		0.3	□□□□□ -2.36
EST2	YLR318W	YLL066W-B	Q8TGJ7	56 aa		0.29	□□□□□ -2.36
EST2	YLR318W	FMP27	Q06179	2628 aa		0.26	□□□□□ -2.37
EST2	YLR318W	RPL39	P04650	51 aa		0.25	□□□□□ -2.37
EST2	YLR318W	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		0.25	□□□□□ -2.37
EST2	YLR318W	TRA1	P38811	3744 aa		0.22	□□□□□ -2.37
EST2	YLR318W	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	0.22	□□□□□ -2.37
EST2	YLR318W	MEC1	P38111	2368 aa		0.21	□□□□□ -2.38
EST2	YLR318W	IRA2	P19158	3079 aa		0.2	□□□□□ -2.38
EST2	YLR318W	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	0.19	□□□□□ -2.38
EST2	YLR318W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		0.18	□□□□□ -2.38
EST2	YLR318W	CSF1	Q12150	2958 aa		0.14	□□□□□ -2.39
EST2	YLR318W	IRA1	P18963	3092 aa		0.14	□□□□□ -2.39
EST2	YLR318W	TEL1	P38110	2787 aa		0.11	□□□□□ -2.39
EST2	YLR318W	VPS13	Q07878	3144 aa		0.09	□□□□□ -2.4
EST2	YLR318W	TOM1	Q03280	3268 aa		0.05	□□□□□ -2.4
EST2	YLR318W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		0.03	□□□□□ -2.4

Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.6 ms