RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639496.1

KCNQ3-208, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 3, human

TSL 5

Gene KCNQ3, Length 4,943 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNQ3-208	ENST00000639496	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	FTHL17	Q9BXU8	183 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	RNF112	Q9ULX5	631 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	ABCA6	Q8N139	1617 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	DAB2	P98082	770 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	MROH9	Q5TGP6	573 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	GJB7	Q6PEY0	223 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	THAP2	Q9H0W7	228 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	CPS1	P31327	1500 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	GSN	P06396	782 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZNF135	P52742	658 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	CDC16	Q13042	620 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	USP38	Q8NB14	1042 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	SUSD6	Q92537	303 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	E2F7	Q96AV8	911 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	RAB23	Q9ULC3	237 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	TNS2	Q63HR2	1409 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	SGPL1	O95470	568 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	CASP4	P49662	377 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	CNTN2	Q02246	1040 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	PRKAA1	Q13131	559 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	LONRF1	Q17RB8	773 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	C3orf20	Q8ND61	904 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	NT5M	Q9NPB1	228 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	USP18	Q9UMW8	372 aa		10.61	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	PPP1R37	O75864	691 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	BMP10	O95393	424 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	GLP2R	O95838	553 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	GYPC	P04921	128 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	RBP1	P09455	135 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	KRT20	P35900	424 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	DDR1	Q08345	913 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	STX5	Q13190	355 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	ITGA9	Q13797	1035 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	FIGN	Q5HY92	759 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	FAM162A	Q96A26	154 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	SGF29	Q96ES7	293 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	IGFLR1	Q9H665	355 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	IGSF6	O95976	241 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	AKAP5	P24588	427 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	TC2N	Q8N9U0	490 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	TMEM159	Q96B96	161 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	WNK4	Q96J92	1243 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	AHSP	Q9NZD4	102 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	RASSF10	A6NK89	507 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	PJA2	O43164	708 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	GLRA3	O75311	464 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	LGALS2	P05162	132 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	PPM1A	P35813	382 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	RAD54B	Q9Y620	910 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	ZNF185	O15231	689 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	PROSC	O94903	275 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	RPN2	P04844	631 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	RRM1	P23921	792 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	OR1E1	P30953	314 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	HAL	P42357	657 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	TRPC1	P48995	793 aa		10.6	□□□□□ -0.71
KCNQ3-208	ENST00000639496	POLE2	P56282	527 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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