RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 DESI2Q9BSY9 194 aa8.95□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 ISCUQ9H1K1 167 aa8.95□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.95□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 ASAH2Q9NR71 780 aa8.95□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 TTLL2Q9BWV7 592 aa8.94□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 THAP2Q9H0W7 228 aa8.94□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 MYO1AQ9UBC5 1043 aa8.94□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 PGFP49763 221 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 COL19A1Q14993 1142 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 TAF5Q15542 800 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 EFHC1Q5JVL4 640 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 PM20D1Q6GTS8 502 aa8.93□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 DNAJC24Q6P3W2 148 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.93□□□□□ -0.98
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SGMS1-211ENST00000626236 H2AFVQ71UI9 128 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 GPR149Q86SP6 731 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA1328Q86T90 577 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 SCML4Q8N228 414 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.93□□□□□ -0.98
SGMS1-211ENST00000626236 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.93□□□□□ -0.98
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