RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF534Q76KX8 674 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 CHSY1Q86X52 802 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 MAB21L3Q8N8X9 362 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 HPDLQ96IR7 371 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 CNPY3Q9BT09 278 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 MAGEB5Q9BZ81 275 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 DLDP09622 509 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 VDRP11473 427 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 IGBP1P78318 339 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 SMYD5Q6GMV2 418 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 OLFML1Q6UWY5 402 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 PCDH19Q8TAB3 1148 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF398Q8TD17 642 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 CLMNQ96JQ2 1002 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa13.91□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 CHADO15335 359 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 PDGFRAP16234 1089 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 RBL1P28749 1068 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 RGS7P49802 495 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 FAM187BQ17R55 369 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 PKDCCQ504Y2 493 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 LCLAT1Q6UWP7 414 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 TTC30AQ86WT1 665 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 CFAP36Q96G28 342 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 FAXDC2Q96IV6 333 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 PNPLA8Q9NP80 782 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ADM5C9JUS6 153 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 SMAPO00193 183 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 MT-ND3P03897 115 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 TPBGLP0DKB5 382 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 MCF2P10911 925 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 PMF1Q6P1K2 205 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 TTC7BQ86TV6 843 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 FAF2Q96CS3 445 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 LPIN3Q9BQK8 851 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 TSSK1BQ9BXA7 367 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 PCDH18Q9HCL0 1135 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ARHGEF4Q9NR80 690 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 RAB6BQ9NRW1 208 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0G2JND7 137 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 HMX2A2RU54 273 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 PPEF2O14830 753 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 KCNN4O15554 427 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ENTPD5O75356 428 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 VTNP04004 478 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 ALDH3A1P30838 453 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 SLC9A4Q6AI14 798 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 OR6B2Q6IFH4 312 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 MIEF2Q96C03 454 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 MECRQ9BV79 373 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 CYP3A43Q9HB55 503 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 HEY2Q9UBP5 337 aa13.9□□□□□ -0.18
C9orf170-201ENST00000623052 HBP1O60381 514 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 PTPN4P29074 926 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ATICP31939 592 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 STIP1P31948 543 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ABL2P42684 1182 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 FYB2Q5VWT5 728 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 MPP5Q8N3R9 675 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 TTC17Q96AE7 1141 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ELP3Q9H9T3 547 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 H7C0C1 242 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 DPYSL4O14531 572 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CSH1P0DML2 217 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 CSH2P0DML3 217 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 INSRRP14616 1297 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 SERPINB3P29508 390 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ATP5OP48047 213 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 OTUD5Q96G74 571 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 GJD2Q9UKL4 321 aa13.89□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa13.88□□□□□ -0.19
C9orf170-201ENST00000623052 HCRTO43612 131 aa13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms