RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	ACKR2	O00590	384 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	RASSF9	O75901	435 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP2F1	P24903	491 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	SERPINB4	P48594	390 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CCNA1	P78396	465 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	TTC7B	Q86TV6	843 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CPT1B	Q92523	772 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CIT	O14578	2027 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	WDR27	A2RRH5	827 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM63A	O94886	807 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ARIH2	O95376	493 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP4A	P20648	1035 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CDKN2B	P42772	138 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	RASA2	Q15283	850 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	C6orf89	Q6UWU4	347 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	EDEM1	Q92611	657 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	NUDT5	Q9UKK9	219 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449		M0QYT0	321 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	UGT1A9	O60656	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC22	O60826	627 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	FBXO41	Q8TF61	875 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	NSL1	Q96IY1	281 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	GML	Q99445	158 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		13.24	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449		H3BRB1	525 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	FCHO1	O14526	889 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ATP5H	O75947	161 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	STAMBP	O95630	424 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	GSTA1	P08263	222 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	SKI	P12755	728 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	KPNB1	Q14974	876 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CDKL3	Q8IVW4	592 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	LGMN	Q99538	433 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449		M0QZ92	97 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	AIM2	O14862	343 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	UNC5C	O95185	931 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP2C9	P11712	490 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	XRCC4	Q13426	336 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	GPR162	Q16538	588 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ZPBP2	Q6X784	338 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	SYT11	Q9BT88	431 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	BTAF1	O14981	1849 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	PDE5A	O76074	875 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	LSM8	O95777	96 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	EDN1	P05305	212 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	PCSK7	Q16549	785 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	DNAJC16	Q9Y2G8	782 aa		13.23	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	VDR	P11473	427 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	GBE1	Q04446	702 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	CYP1B1	Q16678	543 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	MMEL1	Q495T6	779 aa		13.22	□□□□□ -0.29
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29

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