RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNA10	Q16322	511 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	WSCD1	Q658N2	575 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	NENF	Q9UMX5	172 aa		10.26	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP9B	O43861	1147 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	KPNA6	O60684	536 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HUS1	O60921	280 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM107A	O95990	144 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CYBA	P13498	195 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CDC25C	P30307	473 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TAF12	Q16514	161 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	IZUMO3	Q5VZ72	239 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PRELID2	Q8N945	189 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNN1	Q92952	543 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232		Q9Y3F1	56 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PAX3	P23760	479 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	NOMO3	P69849	1222 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	OVGP1	Q12889	678 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ACTL9	Q8TC94	416 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PDCD6IP	Q8WUM4	868 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MBLAC1	A4D2B0	266 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	KCNN4	O15554	427 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MED7	O43513	233 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TPH1	P17752	444 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ASPA	P45381	313 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SPDL1	Q96EA4	605 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RAB6B	Q9NRW1	208 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		10.25	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MIF4GD	A9UHW6	222 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MDM4	O15151	490 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RBP3	P10745	1247 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GNL1	P36915	607 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	FUK	Q8N0W3	1084 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MFHAS1	Q9Y4C4	1052 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GMNC	A6NCL1	334 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP1A2	P05177	515 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RNF180	Q86T96	592 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ABI1	Q8IZP0	508 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	DNAAF3	Q8N9W5	541 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		10.24	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	HAS3	O00219	553 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RASGRF2	O14827	1237 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	USP17L7	P0C7H9	530 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	NCAM1	P13591	858 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PMS2	P54278	862 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	OTUD4	Q01804	1114 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	OGDH	Q02218	1023 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	PCSK7	Q16549	785 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	CD302	Q8IX05	232 aa		10.23	□□□□□ -0.77
CTCFL-222	ENST00000609232	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		10.23	□□□□□ -0.77

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.8 ms