RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC6A3Q01959 620 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TDRPQ86YL5 185 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PALM2Q8IXS6 379 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC33Q8N5R6 958 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBF1Q8TES7 1133 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC35F5Q8WV83 523 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAGEB18Q96M61 343 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMC6Q96SB8 1091 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAGEB5Q9BZ81 275 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RRN3P2A6NIE6 340 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LMO2P25791 158 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TFDP2Q14188 446 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZBTB6Q15916 424 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP11CQ8NB49 1132 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPOCK2Q92563 424 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TBC1D31Q96DN5 1066 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNF39Q9H2S5 420 aa22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP6V1G2O95670 118 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OAS1P00973 400 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STILQ15468 1287 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAXCQ5TGI0 409 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDIK1LQ8N165 341 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLD5Q8N7P1 536 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCNN4O15554 427 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AVILO75366 819 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RPSAP08865 295 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FGFR1P11362 822 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LCP1P13796 627 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TAC1P20366 129 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL9RQ01113 521 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NR1H3Q13133 447 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPATA21Q7Z572 469 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa22.67■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPTLC1O15269 473 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHBP35232 272 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CGB2Q6NT52 195 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TLDC1Q6P9B6 456 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM110Q86TL2 294 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MAP7D3Q8IWC1 876 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIRREL3Q8IZU9 778 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PQLC3Q8N755 202 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOD2Q9HC29 1040 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDH18Q9HCL0 1135 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GRID1Q9ULK0 1009 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DERAQ9Y315 318 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SCN1AP35498 2009 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CA4P22748 312 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EFHC2Q5JST6 749 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAF2Q96CS3 445 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAB6BQ9NRW1 208 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC24A2Q9UI40 661 aa22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NRCAMQ92823 1304 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SUN1O94901 812 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RBL1P28749 1068 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ELK3P41970 407 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HDAC4P56524 1084 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BCAR1P56945 870 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAJC3Q13217 504 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ACCSLQ4AC99 568 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BOLA3Q53S33 107 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRRC52Q8N7C0 313 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PAFAH2Q99487 392 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A6NJR5 290 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 APOL1O14791 398 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TREHO43280 583 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ASMTLO95671 621 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 F2P00734 622 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KRT4P19013 534 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STIP1P31948 543 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MFSD10Q14728 455 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TLK2Q86UE8 772 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CNTN3Q9P232 1028 aa22.65■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22.64■■□□□ 1.22
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 E7ESA3 106 aa22.64■■□□□ 1.21
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GOLGA8RI6L899 631 aa22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms