RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 SOX11P35716 441 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 RAP1GAPP47736 663 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SCTRP47872 440 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 YARSP54577 528 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 IGBP1P78318 339 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ROR1Q01973 937 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GAS6Q14393 721 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SPARCL1Q14515 664 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT81Q14533 505 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PDK2Q15119 407 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 VSTM1Q6UX27 236 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 C4orf22Q6V702 233 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA21Q7Z572 469 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SESTD1Q86VW0 696 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBED8Q8IZ13 594 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PDIK1LQ8N165 341 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01465Q8N7H1 131 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ACTL9Q8TC94 416 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 USP6NLQ92738 828 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 HAUS1Q96CS2 278 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CLMNQ96JQ2 1002 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf72Q96LT7 481 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TBCBQ99426 244 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 NT5C1AQ9BXI3 368 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ELOVL4Q9GZR5 314 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TXNRD2Q9NNW7 524 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 IGSF5Q9NSI5 407 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 HAUS2Q9NVX0 235 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa9.62□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WZ62 844 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 RRN3P2A6NIE6 340 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF487B1APH4 448 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GPR25O00155 361 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 STRNO43815 780 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SNX3O60493 162 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPAN1O60635 241 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PEX10O60683 326 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF15O94989 841 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZWINTO95229 277 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 OAS1P00973 400 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CETPP11597 493 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TCF4P15884 667 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TGM2P21980 687 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 DYNLT1P63172 113 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 MOGSQ13724 837 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 NUGGCQ68CJ6 796 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 MTHFD1LQ6UB35 978 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 LCLAT1Q6UWP7 414 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TRABD2AQ86V40 505 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SVOPQ8N4V2 548 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CEP120Q8N960 986 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 JOSD2Q8TAC2 188 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 PYROXD1Q8WU10 500 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TEKT4Q8WW24 435 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 COPS5Q92905 334 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPAN18Q96SJ8 248 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CPXM1Q96SM3 734 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 TRABDQ9H4I3 376 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC40A1Q9NP59 571 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 DPP3Q9NY33 737 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 EURLQ9NYK6 297 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHL14Q9P2G3 628 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 HESX1Q9UBX0 185 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 USP18Q9UMW8 372 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC12A4Q9UP95 1085 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 AGAP1Q9UPQ3 857 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-222ENST00000592408 ANK1P16157 1881 aa9.6□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms