RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 CCSER2Q9H7U1 834 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PNPLA8Q9NP80 782 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 FAM49BQ9NUQ9 324 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 RMND1Q9NWS8 449 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 MMP17Q9ULZ9 603 aa21.84■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 A0A0A0MRY4 1105 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 STX10O60499 249 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 TLR5O60602 858 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 BEST1O76090 585 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 KAT7O95251 611 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 APODP05090 189 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 GRIA2P42262 883 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 DGKEP52429 567 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 GAD2Q05329 585 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ELF2Q15723 593 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 KRT39Q6A163 491 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 SCML2Q9UQR0 700 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.83■■□□□ 1.09
NFIC-209ENST00000589969 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 CETN3O15182 167 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 RHOBTB1O94844 696 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ZNF806P0C7X5 589 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ADORA2BP29275 332 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 TNFRSF4P43489 277 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 SEC13P55735 322 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 GOLGA8FQ08AF8 430 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 PLK5Q496M5 336 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 LY6G5CQ5SRR4 150 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 NUDT18Q6ZVK8 323 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 CYLDQ9NQC7 956 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ARHGEF4Q9NR80 690 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ATG2BQ96BY7 2078 aa21.82■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa21.81■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 CILPO75339 1184 aa21.81■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 SLC6A11P48066 632 aa21.81■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 CLEC20AQ6ZU45 233 aa21.81■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 TWNKQ96RR1 684 aa21.81■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.81■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 GDPD2Q9HCC8 539 aa21.81■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.089e-9■■■■■ 111.8
NFIC-209ENST00000589969 DCDC2BA2VCK2 349 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ALDH1A2O94788 518 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 LIMK1P53667 647 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 BECN1Q14457 450 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 CRY1Q16526 586 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 KLHDC10Q6PID8 442 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 HTR3DQ70Z44 454 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 RASSF3Q86WH2 238 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 BBS7Q8IWZ6 715 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 KCNV2Q8TDN2 545 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 SPHK2Q9NRA0 654 aa21.8■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 HHLA1C9JL84 531 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 CD58P19256 250 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ACO1P21399 889 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 PSEN1P49768 467 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 MXI1P50539 228 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 COBLL1Q53SF7 1204 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 EOGTQ5NDL2 527 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 PLA2G2CQ5R387 149 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 TADA2BQ86TJ2 420 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 C12orf40Q86WS4 652 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 CCDC33Q8N5R6 958 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 WHAMMQ8TF30 809 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 GSDMAQ96QA5 445 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 TSG101Q99816 390 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 VPS45Q9NRW7 570 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 DEC1Q9P2X7 70 aa21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 SMC2O95347 1197 aa21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 MPLP40238 635 aa21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 PNOCQ13519 176 aa21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ANO7Q6IWH7 933 aa21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ZNF276Q8N554 614 aa21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 ALLCQ8N6M5 410 aa21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 IL17RCQ8NAC3 791 aa21.78■■□□□ 1.08
NFIC-209ENST00000589969 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms