RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	MANEAL	Q5VSG8	457 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANO1	Q5XXA6	986 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	MZT2A	Q6P582	158 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF627	Q7L945	461 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	DTX2	Q86UW9	622 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	FUBP1	Q96AE4	644 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	ALG8	Q9BVK2	526 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	STK33	Q9BYT3	514 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
NEDD4L-222	ENST00000588494	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	AQP12B	A6NM10	295 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	AGPS	O00116	658 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	AP4M1	O00189	453 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	PROM1	O43490	865 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	TOM1	O60784	492 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	NBN	O60934	754 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	TCEA3	O75764	348 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP1	O94782	785 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	ESRRB	O95718	433 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	TTLL1	O95922	423 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	GABRB3	P28472	473 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP2C18	P33260	490 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	CHKA	P35790	457 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	SEC24C	P53992	1094 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	TPTE	P56180	551 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZXDA	P98168	799 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	FOXI1	Q12951	378 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	BMPR2	Q13873	1038 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	P3H2	Q8IVL5	708 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	PBK	Q96KB5	322 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAST3	O60307	1309 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	SHROOM2	Q13796	1616 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		3.58	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	LINC00473	A8K010	186 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	LGALS16	A8MUM7	142 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	QSOX1	O00391	747 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	EXOC5	O00471	708 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	CES2	O00748	559 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	RAMP2	O60895	175 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	ONECUT2	O95948	504 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	EGR1	P18146	543 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	RBL1	P28749	1068 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	CXCR5	P32302	372 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	ADRA1B	P35368	520 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	MPL	P40238	635 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	GRIA3	P42263	894 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	GDF5	P43026	501 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	TAP1	Q03518	808 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	BLMH	Q13867	455 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	PFKFB4	Q16877	469 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM153C	Q494X1	144 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRR16	Q569H4	304 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF551	Q7Z340	670 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	TTC30A	Q86WT1	665 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494		Q8N1X5	172 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	MYCT1	Q8N699	235 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	STYX	Q8WUJ0	223 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCT6B	Q92526	530 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	RFK	Q969G6	155 aa		3.57	□□□□□ -1.84
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM227B	Q96M60	508 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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