RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588340.1

EFTUD2-210, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM92AA1XBS5 289 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 K7ESF4 209 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 LEFTY2O00292 366 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 TNFRSF10BO14763 440 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 CAVIN2O95810 425 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 OLFM2O95897 454 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 ABL1P00519 1130 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 OAS1P00973 400 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 AFPP02771 609 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC192P0DO97 292 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 YWHAQP27348 245 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 GJA4P35212 333 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 PIK3CAP42336 1068 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 IFNAR2P48551 515 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 GALK1P51570 392 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 NDST1P52848 882 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC7A9P82251 487 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 MYL5Q02045 173 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 ORC1Q13415 861 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 NFKBIBQ15653 356 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 MAN2A1Q16706 1144 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 EML3Q32P44 896 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 FSTL4Q6MZW2 842 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM35AQ86V20 835 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 FUKQ8N0W3 1084 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 CPA6Q8N4T0 437 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 DCLK2Q8N568 766 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 TTC39CQ8N584 583 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 ATP2A3Q93084 1043 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 TWNKQ96RR1 684 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 ARID3AQ99856 593 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 HINFPQ9BQA5 517 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 EPC1Q9H2F5 836 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 LINC00597Q9H2U6 94 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 C2orf42Q9NWW7 574 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 IL37Q9NZH6 218 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 HMGXB4Q9UGU5 601 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 WNT6Q9Y6F9 365 aa7.26□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNJ18B7U540 433 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 AP1G2O75843 785 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 BEST1O76090 585 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 EGFP01133 1207 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC130P13994 396 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 DRD1P21728 446 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 HOXA6P31267 233 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 FNTBP49356 437 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC5A3P53794 718 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 DMWDQ09019 674 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNMA1Q12791 1236 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 NR1H3Q13133 447 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 CUL2Q13617 745 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 KCNJ12Q14500 433 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 KRT31Q15323 416 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 MEA1Q16626 185 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 PKDCCQ504Y2 493 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SNX30Q5VWJ9 437 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SASS6Q6UVJ0 657 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 KIAA2013Q8IYS2 634 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 KIAA1958Q8N8K9 716 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 C12orf29Q8N999 325 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 PDZD8Q8NEN9 1154 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 ZMIZ2Q8NF64 920 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 OVCA2Q8WZ82 227 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SHC3Q92529 594 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 TATDN2Q93075 761 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 FBXO32Q969P5 355 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 EXOC4Q96A65 974 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 SMOQ99835 787 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.25□□□□□ -1.25
EFTUD2-210ENST00000588340 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms