RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 PCDH15Q96QU1 1955 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 PTPRDP23468 1912 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MEI4A8MW99 385 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 CER1O95813 267 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 LDHAP00338 332 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 PRB1P04280 392 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 CD6P30203 668 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM25Q86YD3 366 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MIB1Q86YT6 1006 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SCUBE3Q8IX30 993 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GALNT15Q8N3T1 639 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 CXorf38Q8TB03 319 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 RAD54LQ92698 747 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 HVCN1Q96D96 273 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 CRELD1Q96HD1 420 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 PCED1BQ96HM7 432 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 HPDLQ96IR7 371 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 FAM84AQ96KN4 292 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 C8orf48Q96LL4 319 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MMS19Q96T76 1030 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 KIF2CQ99661 725 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 CDC6Q99741 560 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MTMR12Q9C0I1 747 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GAREM1Q9H706 876 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 TM7SF3Q9NS93 570 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SIX4Q9UIU6 781 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 HCN2Q9UL51 889 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 TCHHQ07283 1943 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MYH11P35749 1972 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 A0A087WV48 116 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 TRIM24O15164 1050 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 COCHO43405 550 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF883P0CG24 379 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 WARSP23381 471 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 YWHAQP27348 245 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MATKP42679 507 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ABCG1P45844 678 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MDH1BQ5I0G3 518 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 HECTD3Q5T447 861 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 IL27RAQ6UWB1 636 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SFR1Q86XK3 245 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MARCH9Q86YJ5 346 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 BBS7Q8IWZ6 715 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SYCP3Q8IZU3 236 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SLC39A7Q92504 469 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 FBXO32Q969P5 355 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MRGPRX1Q96LB2 322 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ACCSQ96QU6 501 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ACOX2Q99424 681 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GABRG3Q99928 467 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SLC6A17Q9H1V8 727 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 SNX25Q9H3E2 840 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 IL21RQ9HBE5 538 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 PDE11AQ9HCR9 933 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 CD93Q9NPY3 652 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 RAD54BQ9Y620 910 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 PI4KAP42356 2102 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 TK2O00142 265 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 FLRT2O43155 660 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 CILPO75339 1184 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 PPP1R37O75864 691 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 TNNC2P02585 160 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 IRF1P10914 325 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 NCAM1P13591 858 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GARTP22102 1010 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 DDIT3P35638 169 aa9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRM-210ENST00000578916 KCNA1Q09470 495 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms