RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577001.1

PRPF8-216, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, human

TSL 5

Gene PRPF8, Length 3,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	MORF4L2	Q15014	288 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF618	Q5T7W0	954 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	RNF148	Q8N7C7	305 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	CDT1	Q9H211	546 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SDAD1	Q9NVU7	687 aa	Known RBP eCLIP	15.42	■□□□□ 0.06	5e-10	■■□□□ 12.6
PRPF8-216	ENST00000577001	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	FCHO1	O14526	889 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	METTL18	O95568	372 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	RFC5	P40937	340 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	AQP5	P55064	265 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	RNF220	Q5VTB9	566 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PMF1	Q6P1K2	205 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		15.42	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	LTBP1	Q14766	1721 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	DPPA5	A6NC42	116 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	CSH1	P0DML2	217 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	CSH2	P0DML3	217 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	CCDC130	P13994	396 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	RASSF2	P50749	326 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	BST1	Q10588	318 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	VGLL4	Q14135	290 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	ZNF677	Q86XU0	584 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	TREML1	Q86YW5	311 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	NME8	Q8N427	588 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	REPS2	Q8NFH8	660 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	15.41	■□□□□ 0.06	5e-7	■□□□□ 10.9
PRPF8-216	ENST00000577001	HPDL	Q96IR7	371 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	EVPL	Q92817	2033 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PHB	P35232	272 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SLC25A3	Q00325	362 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SLCO2A1	Q92959	643 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	KIF12	Q96FN5	646 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	YY1AP1	Q9H869	796 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	EURL	Q9NYK6	297 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	KCNK1	O00180	336 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	DGKI	O75912	1065 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	LMNB2	Q03252	620 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	RNF43	Q68DV7	783 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	TNS4	Q8IZW8	715 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		15.41	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SERPINB4	P48594	390 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	NME3	Q13232	169 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	EBF2	Q9HAK2	575 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	WDR27	A2RRH5	827 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	TPBGL	P0DKB5	382 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	NCF2	P19878	526 aa	Predicted RBP	15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	MLH1	P40692	756 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		15.4	■□□□□ 0.06
PRPF8-216	ENST00000577001	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	ITM2A	O43736	263 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	PLA2G6	O60733	806 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	INSRR	P14616	1297 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	TPH1	P17752	444 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	PGM1	P36871	562 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	CCR10	P46092	362 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	RASA2	Q15283	850 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	VPS11	Q9H270	941 aa		15.39	■□□□□ 0.05
PRPF8-216	ENST00000577001	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		15.39	■□□□□ 0.05

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