RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576084.5

COX11-208, Transcript of cytochrome c oxidase copper chaperone COX11, human

TSL 3

Gene COX11, Length 652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COX11-208	ENST00000576084	JTB	O76095	146 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PRKCG	P05129	697 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	BCAT1	P54687	386 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	TBX4	P57082	545 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	ZNF750	Q32MQ0	723 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PCID2	Q5JVF3	399 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	KRT78	Q8N1N4	520 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	XAGE5	Q8WWM1	108 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PRR25	Q96S07	402 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	DKK4	Q9UBT3	224 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.15	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	SYNM	O15061	1565 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	AGPS	O00116	658 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	QSOX1	O00391	747 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PRC1	O43663	620 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PDE8B	O95263	885 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	CELA2A	P08217	269 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	FPR3	P25089	353 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	UQCRC1	P31930	480 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PRKAG1	P54619	331 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PDE1A	P54750	535 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PSG6	Q00889	435 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	SATB1	Q01826	763 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	CCNI	Q14094	377 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PTF1A	Q7RTS3	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	DDB2	Q92466	427 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PHKB	Q93100	1093 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	APOL5	Q9BWW9	433 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	STK31	Q9BXU1	1019 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	MID2	Q9UJV3	735 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	AGL	P35573	1532 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	JCAD	Q9P266	1359 aa		4.14	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	AP4M1	O00189	453 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	MGEA5	O60502	916 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	NPS	P0C0P6	89 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	SLC5A1	P13866	664 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	ACVR2A	P27037	513 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	GNAL	P38405	381 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	TPTE	P56180	551 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	TIRAP	P58753	221 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	E2F1	Q01094	437 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	FHL3	Q13643	280 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	ARHGEF7	Q14155	803 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	INSC	Q1MX18	579 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	UNC13D	Q70J99	1090 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	CYP2W1	Q8TAV3	490 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	ZBTB45	Q96K62	511 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	KIF27	Q86VH2	1401 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	RERE	Q9P2R6	1566 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	TCRBV5S1A1T	A0A578	114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	SPRY2	O43597	315 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	PMPCB	O75439	489 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	RASSF9	O75901	435 aa		4.12	□□□□□ -1.75
COX11-208	ENST00000576084	MT-ND5	P03915	603 aa		4.12	□□□□□ -1.75

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