RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 IRGQQ8WZA9 623 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 PPP2R3CQ969Q6 453 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 SELENOOQ9BVL4 669 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 NUP85Q9BW27 656 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TSGA10Q9BZW7 698 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 LZTFL1Q9NQ48 299 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 PARVAQ9NVD7 372 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 SCML2Q9UQR0 700 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 SCINQ9Y6U3 715 aa16.2■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 DOCK4Q8N1I0 1966 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 CCP110O43303 1012 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 KRT86O43790 486 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 MTA2O94776 668 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 HYAL1Q12794 435 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TAF5Q15542 800 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 VN1R2Q8NFZ6 395 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 JOSD2Q8TAC2 188 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 FEZF2Q8TBJ5 459 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 FBXO32Q969P5 355 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 PSMG2Q969U7 264 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 MYRFLQ96LU7 910 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 IGFLR1Q9H665 355 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 THEGQ9P2T0 379 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 UVRAGQ9P2Y5 699 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 DPP7Q9UHL4 492 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 GUCA1BQ9UMX6 200 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ASB3Q9Y575 518 aa16.19■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 YJEFN3A6XGL0 299 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 E7ENQ6 273 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 CCL16O15467 120 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 SART1O43290 800 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 RFPL2O75678 378 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 GRAP2O75791 330 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 KRT3P12035 628 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 HOXA9P31269 272 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 HADHBP55084 474 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 CTC1Q2NKJ3 1217 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 SCD5Q86SK9 330 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ITIH5Q86UX2 942 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ZSCAN30Q86W11 494 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 HLA-CQ95604 372 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 EHD2Q9NZN4 543 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa16.18■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 MACROD2A1Z1Q3 448 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TMEM191CA6NGB0 347 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 BUB1O43683 1085 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 HSF2BPO75031 334 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 GLP2RO95838 553 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 LTFP02788 710 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 GLI1P08151 1106 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 PGFP49763 221 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TAF10Q12962 218 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TAF12Q16514 161 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TRNP1Q6NT89 227 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 DCUN1D2Q6PH85 259 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 EMC1Q8N766 993 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 EFHBQ8N7U6 833 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 CASP10Q92851 521 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 MCEEQ96PE7 176 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 LRRC3Q9BY71 257 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 TRIM7Q9C029 511 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 NMUR1Q9HB89 426 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 GMIPQ9P107 970 aa16.17■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 MYOFQ9NZM1 2061 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 A0A1W2PQH9 124 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 C2CD4BA6NLJ0 364 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 LINC01565O15544 149 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 DAB1O75553 588 aa16.16■□□□□ 0.18
CTU2-209ENST00000567316 MOCS3O95396 460 aa16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms