RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 GPC5P78333 572 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZXDAP98168 799 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 BHLHA9Q7RTU4 235 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 MFSD6LQ8IWD5 586 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLEC4CQ8WTT0 213 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 STK32AQ8WU08 396 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CNGB3Q9NQW8 809 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 DUSP12Q9UNI6 340 aa22.02■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 PI4K2BG5E9Z4 385 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CBFA2T2O43439 604 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 OLFM2O95897 454 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 TBX18O95935 607 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 TPM3P06753 285 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 RARGP13631 454 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALADP13716 330 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSMC3P17980 439 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 RPL34P49207 117 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 TUBP50607 506 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZXDBP98169 803 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDCLQ13371 301 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCUBE3Q8IX30 993 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIN3Q8TB24 985 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 EPHX3Q9H6B9 360 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 OBP2AQ9NY56 170 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 TJP2Q9UDY2 1190 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 LRRC53A6NM62 1247 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 YJEFN3A6XGL0 299 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 E5RJQ4 531 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 E7ENQ6 273 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRFP11831 508 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHRNB2P17787 502 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 PSEN1P49768 467 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 DAOAP59103 153 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC7A9P82251 487 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 UBALD2Q8IYN6 164 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 EDAQ92838 391 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPXM1Q96SM3 734 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 NACA2Q9H009 215 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYLDQ9NQC7 956 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYO6Q9UM54 1294 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CEP83Q9Y592 693 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPQQ9Y646 472 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 AP5Z1O43299 807 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 GDI1P31150 447 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACADSBP45954 432 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDR2Q01850 454 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 FIGNQ5HY92 759 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM110Q86TL2 294 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 YAF2Q8IY57 180 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ARHGAP18Q8N392 663 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 BPIFB1Q8TDL5 484 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUP58Q9BVL2 599 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF9Q9HAQ2 790 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CLIC5Q9NZA1 410 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 MDM4O15151 490 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 FERP16591 822 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 FMO1Q01740 532 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 C10orf120Q5SQS8 335 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF677Q86XU0 584 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 SCML4Q8N228 414 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMEM35BQ8NCS4 154 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZFYVE19Q96K21 471 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRD9Q9H8M2 597 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO21O94952 628 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 RALAP11233 206 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 FCHO2Q0JRZ9 810 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF77Q15935 545 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 BSPRYQ5W0U4 402 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 EDEM1Q92611 657 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 NOX5Q96PH1 765 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 GKN1Q9NS71 199 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 LEFTY2O00292 366 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF263O14978 683 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPN20Q4JDL3 420 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 SFMBT2Q5VUG0 894 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 CPA5Q8WXQ8 436 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-208ENST00000566515 IRGQQ8WZA9 623 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms