RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566231.5

CMC2-216, Transcript of C-X9-C motif containing 2, human

TSL 3

Gene CMC2, Length 652 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CMC2-216	ENST00000566231	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	FGL2	Q14314	439 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	TREML2	Q5T2D2	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	SLC29A4	Q7RTT9	530 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	TRIM63	Q969Q1	353 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	TBATA	Q96M53	351 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CMC2-216	ENST00000566231	TISP43	B9A030	160 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231		J3KRW8	73 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	MYO1F	O00160	1098 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	EYA2	O00167	538 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	APOL1	O14791	398 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	PRR35	P0CG20	571 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	SLC7A1	P30825	629 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	CYP2C18	P33260	490 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	HSPA7	P48741	367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	EEFSEC	P57772	596 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	ICA1	Q05084	483 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	BLMH	Q13867	455 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	STARD3	Q14849	445 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	MTX3	Q5HYI7	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	FANCB	Q8NB91	859 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231		A0A1W2PPL8	197 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	QSOX1	O00391	747 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	FFAR2	O15552	330 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	FRS3	O43559	492 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	SNX2	O60749	519 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	IL18RAP	O95256	599 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	ONECUT2	O95948	504 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	FES	P07332	822 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	GRP	P07492	148 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	NPR1	P16066	1061 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	EPHB2	P29323	1055 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	DAG1	Q14118	895 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	KCTD2	Q14681	263 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	IQCB1	Q15051	598 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	POSTN	Q15063	836 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	TAF5	Q15542	800 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	CNGA2	Q16280	664 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	WDR53	Q7Z5U6	358 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	NEK8	Q86SG6	692 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	PDILT	Q8N807	584 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CMC2-216	ENST00000566231	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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