RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559322.5

SEMA4B-211, Transcript of semaphorin 4B, humanhuman

TSL 4

Gene SEMA4B, Length 559 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4B-211ENST00000559322 SCFD1Q8WVM8 642 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA4B-211ENST00000559322 MRGPRX1Q96LB2 322 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA4B-211ENST00000559322 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SEMA4B-211ENST00000559322 SPHK2Q9NRA0 654 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA4B-211ENST00000559322 HCN2Q9UL51 889 aa20.52■□□□□ 0.88
SEMA4B-211ENST00000559322 F8VP50 259 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 TRIM24O15164 1050 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 NCAM1P13591 858 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 LMO2P25791 158 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 WNT7BP56706 349 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 HLA-BQ31612 363 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 CCDC157Q569K6 752 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 CALML4Q96GE6 196 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 FIZ1Q96SL8 496 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 URB1O60287 2271 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 DKK1O94907 266 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 PDGFRBP09619 1106 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 ADSSP30520 456 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 MYO1EQ12965 1108 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 CAMK2BQ13554 666 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 DPH6Q7L8W6 267 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 TMEM25Q86YD3 366 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 BBS7Q8IWZ6 715 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 DNASE2BQ8WZ79 361 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 PCED1BQ96HM7 432 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 C8orf48Q96LL4 319 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 GABRG3Q99928 467 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 GPR174Q9BXC1 333 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 CD248Q9HCU0 757 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 RAI2Q9Y5P3 530 aa20.5■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 BPTFQ12830 3046 aa20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 SAAL1Q96ER3 474 aa20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 FAM84AQ96KN4 292 aa20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa20.49■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 CAPN9O14815 690 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 COCHO43405 550 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 HLA-EP13747 358 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 ITPKBP27987 946 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 MCM6Q14566 821 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 MDH1BQ5I0G3 518 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 DCAF12L1Q5VU92 463 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 PDZD8Q8NEN9 1154 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 CXorf38Q8TB03 319 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.48■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 E9PAM4 449 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 IRF1P10914 325 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 YWHAQP27348 245 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 UBA7P41226 1012 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 RILPL1Q5EBL4 403 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 HECTD3Q5T447 861 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 CADM4Q8NFZ8 388 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 FBXO32Q969P5 355 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 HVCN1Q96D96 273 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 HPDLQ96IR7 371 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 MMS19Q96T76 1030 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 NACA2Q9H009 215 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 SIX4Q9UIU6 781 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.47■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 GFRA2O00451 464 aa20.46■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 SLC26A4O43511 780 aa20.46■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 TNFSF14O43557 240 aa20.46■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 STARD3Q14849 445 aa20.46■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.46■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 ZNF843Q8N446 348 aa20.46■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa20.46■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
SEMA4B-211ENST00000559322 BBS2Q9BXC9 721 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms