RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553215.5

EGLN3-209, Transcript of egl-9 family hypoxia inducible factor 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EGLN3, Length 1,004 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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EGLN3-209ENST00000553215 PGBD3Q8N328 593 aa12.72□□□□□ -0.37
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EGLN3-209ENST00000553215 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
EGLN3-209ENST00000553215 NT5C1AQ9BXI3 368 aa12.72□□□□□ -0.37
EGLN3-209ENST00000553215 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
EGLN3-209ENST00000553215 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
EGLN3-209ENST00000553215 GDPD2Q9HCC8 539 aa12.72□□□□□ -0.37
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