RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 PDE11AQ9HCR9 933 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL14Q9P2G3 628 aa8.36□□□□□ -1.07
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PTPRB-209ENST00000550857 SOAT2O75908 522 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 CXorf40BQ96DE9 158 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRB-209ENST00000550857 TRIM49CP0CI26 452 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRB-209ENST00000550857 GGT7Q9UJ14 662 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRB-209ENST00000550857 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
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