RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 NFATC1O95644 943 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 VDRP11473 427 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 TDGF1P13385 188 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 CD19P15391 556 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ZNF132P52740 706 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 BCAT1P54687 386 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 GAB4Q2WGN9 574 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ZNF528Q3MIS6 628 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 DGKKQ5KSL6 1271 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 TMEM270Q6UE05 265 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 RRAGAQ7L523 313 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 SCD5Q86SK9 330 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 TFAP2BQ92481 460 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 WBP2Q969T9 261 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ZSWIM1Q9BR11 485 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 UBXN6Q9BZV1 441 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa18.69■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 TBX18O95935 607 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 CYP17A1P05093 508 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 PAEPP09466 180 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 PDE4CQ08493 712 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 PKDCCQ504Y2 493 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 NELL1Q92832 810 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 THAP9Q9H5L6 903 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 R4GN57 208 aa18.68■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ATG2BQ96BY7 2078 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 E2F8A0AVK6 867 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 CALCAP01258 141 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 RARGP13631 454 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 BST2Q10589 180 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 TRIM65Q6PJ69 517 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 TSSK4Q6SA08 328 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 DACH1Q9UI36 760 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 KIAA1257Q9ULG3 409 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 CNTN6Q9UQ52 1028 aa18.67■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 PRR23AA6NEV1 266 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 GREM1O60565 184 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 EGFP01133 1207 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 SETSIPP0DME0 302 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 IRF1P10914 325 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 OPRD1P41143 372 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 PLA2G4AP47712 749 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 PSEN1P49768 467 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 GALK1P51570 392 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 CCR3P51677 355 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 AMPD2Q01433 879 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 SATB1Q01826 763 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 PKN3Q6P5Z2 889 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 KLHDC10Q6PID8 442 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 LCLAT1Q6UWP7 414 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 BHLHA9Q7RTU4 235 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 SYNPOQ8N3V7 929 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 SPEM1Q8N4L4 309 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ZNF276Q8N554 614 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 P2RY13Q9BPV8 354 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 CRACR2AQ9BSW2 395 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 NACA2Q9H009 215 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 C2orf42Q9NWW7 574 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 CLIC5Q9NZA1 410 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 HESX1Q9UBX0 185 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 NAGPAQ9UK23 515 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 NUDT5Q9UKK9 219 aa18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 MDM4O15151 490 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 BRD2P25440 801 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 TKTL1P51854 596 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 SLC8A3P57103 927 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 APBA1Q02410 837 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 NR1H3Q13133 447 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 DHCR24Q15392 516 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 PM20D1Q6GTS8 502 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 GJB7Q6PEY0 223 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 CREBRFQ8IUR6 639 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 BBS7Q8IWZ6 715 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 UBA3Q8TBC4 463 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 CD101Q93033 1021 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ULBP1Q9BZM6 244 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 TBC1D14Q9P2M4 693 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa18.65■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 EML5Q05BV3 1969 aa18.64■□□□□ 0.58
CS-219ENST00000550655 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 325 ms