RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 RAB20Q9NX57 234 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 GREB1Q4ZG55 1949 aa10.25□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 POU2F2P09086 479 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 P4HA1P13674 534 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CEBPBP17676 345 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ATF6P18850 670 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 BDNFP23560 247 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MXI1P50539 228 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 NOP14P78316 857 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ENPEPQ07075 957 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 VAC14Q08AM6 782 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 PLD1Q13393 1074 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ORC1Q13415 861 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 FZD5Q13467 585 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TAF12Q16514 161 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MDH1BQ5I0G3 518 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 PRSS36Q5K4E3 855 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ACOT1Q86TX2 421 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SCN4BQ8IWT1 228 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CCDC150Q8NCX0 1101 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 FBXL13Q8NEE6 735 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SLC35C1Q96A29 364 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MYLPFQ96A32 169 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 PCED1BQ96HM7 432 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 LRRC3Q9BY71 257 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CHRDQ9H2X0 955 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ALG2Q9H553 416 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ASAH2Q9NR71 780 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 HSFX1Q9UBD0 423 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 RWDD2AQ9UIY3 292 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TSC2P49815 1807 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PRU2 124 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SHISA7A6NL88 538 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CLDN5O00501 218 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ZNF197O14709 1029 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MOSPD3O75425 235 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CD58P19256 250 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 NDUFV2P19404 249 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 GRIK1P39086 918 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ASPAP45381 313 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 FMO5P49326 533 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 FNTBP49356 437 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CCR3P51677 355 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 NDST1P52848 882 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SATB1Q01826 763 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 KCNH2Q12809 1159 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 LRMPQ12912 555 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 VEPH1Q14D04 833 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TEAD2Q15562 447 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CCDC6Q16204 474 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 WDR44Q5JSH3 913 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 FOXR2Q6PJQ5 311 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 C4orf50Q6ZRC1 276 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ITIH5Q86UX2 942 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 PSMG2Q969U7 264 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ZSWIM3Q96MP5 696 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 B3GNT5Q9BYG0 378 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 HMGXB4Q9UGU5 601 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ASB3Q9Y575 518 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 F5P12259 2224 aa10.23□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 AKAP13Q12802 2813 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 GNA14O95837 355 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CCDC192P0DO97 292 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 GABRR2P28476 465 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 LIMK1P53667 647 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 EPHA5P54756 1037 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 CFAP221Q4G0U5 840 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ZNF394Q53GI3 561 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 GAREM2Q75VX8 874 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TMC8Q8IU68 726 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TRIM59Q8IWR1 403 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 C12orf29Q8N999 325 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 SHKBP1Q8TBC3 707 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 TNIP3Q96KP6 325 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 MED10Q9BTT4 135 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa10.22□□□□□ -0.77
CS-217ENST00000550044 NIF3L1Q9GZT8 377 aa10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms