RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.53□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 VCANP13611 3396 aa6.53□□□□□ -1.36
CMTM1-220ENST00000534143 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CYB561D2O14569 222 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 GABRDO14764 452 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 NRP1O14786 923 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CYP26A1O43174 497 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 ARHGAP6O43182 974 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CILPO75339 1184 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TACC1O75410 805 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 B3GAT3O94766 335 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 DLGAP3O95886 979 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 ITGB1P05556 798 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 GALTP07902 379 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CCDC172P0C7W6 258 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CHRNB2P17787 502 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 RAP1GAPP47736 663 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 KCNJ6P48051 423 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 RAD23BP54727 409 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TNNC1P63316 161 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 SLC20A2Q08357 652 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 INCA1Q0VD86 236 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 LRP8Q14114 963 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 MTF1Q14872 753 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TIGD5Q53EQ6 642 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 RASIP1Q5U651 963 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TMC7Q7Z402 723 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 ABI1Q8IZP0 508 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TTC39CQ8N584 583 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 RABGGTAQ92696 567 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 SENP8Q96LD8 212 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TWNKQ96RR1 684 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 FAM83CQ9BQN1 747 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF576Q9H609 170 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 HAUS4Q9H6D7 363 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CWH43Q9H720 699 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 ACP6Q9NPH0 428 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 DNAJB4Q9UDY4 337 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 PYCARDQ9ULZ3 195 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 NENFQ9UMX5 172 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TSC2P49815 1807 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 KIAA1671Q9BY89 1806 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 VWA8A3KMH1 1905 aa6.52□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 F8W810 466 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 M0QZQ0 153 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF263O14978 683 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 NRDCO43847 1150 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 NDUFA10O95299 355 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 GJB5O95377 273 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TIAF1O95411 115 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 LCA5LO95447 670 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 EFEMP2O95967 443 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CALCAP01258 141 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 ALDH2P05091 517 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CYP11A1P05108 521 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 PAEPP09466 180 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 KRT5P13647 590 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CYP11B1P15538 503 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 CD58P19256 250 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 ANXA13P27216 316 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 USP8P40818 1118 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 BRCC3P46736 316 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 SLC11A1P49279 550 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 NDST1P52848 882 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 BPIFB4P59827 614 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 ARID5AQ03989 594 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TEX35Q5T0J7 233 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 WSCD1Q658N2 575 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM270Q6UE05 265 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CMTM1-220ENST00000534143 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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