RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 TGFB3P10600 412 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MGAT1P26572 445 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PTGS2P35354 604 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SREBF1P36956 1147 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PIK3CBP42338 1070 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 STT3AP46977 705 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC38Q502W7 563 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PRR16Q569H4 304 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FAM47AQ5JRC9 791 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SUSD4Q5VX71 490 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SMIM5Q71RC9 77 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ATG9AQ7Z3C6 839 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MIER2Q8N344 545 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PPM1NQ8N819 430 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RNF169Q8NCN4 708 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 OR10H5Q8NGA6 315 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KLHDC4Q8TBB5 520 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SLC26A6Q9BXS9 759 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SH3GLB2Q9NR46 395 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 LANCL2Q9NS86 450 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NARFQ9UHQ1 456 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 LRP5O75197 1615 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AOX1Q06278 1338 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GRXCR1A8MXD5 290 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NTSR2O95665 410 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MX1P20591 662 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GPTP24298 496 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PEX2P28328 305 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KLF10Q13118 480 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PRKG2Q13237 762 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 BMT2Q1RMZ1 405 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PARP10Q53GL7 1025 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ERC1Q8IUD2 1116 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ZFP28Q8NHY6 868 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NUP133Q8WUM0 1156 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MAP3K14Q99558 947 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KCNH6Q9H252 994 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CERS4Q9HA82 394 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D22BQ9NU19 505 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MOCS1Q9NZB8 636 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GJD2Q9UKL4 321 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TAF1P21675 1872 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GUL6 1792 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 COL4A1P02462 1669 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RTL9Q8NET4 1388 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 A0A087WV62 115 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FAM171A2A8MVW0 826 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 FAM227AF5H4B4 570 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 KPNA5O15131 536 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TMCC2O75069 709 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TUSC2O75896 110 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CIAO1O76071 339 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 BAIAP3O94812 1187 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 RAP2AP10114 183 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TNFSF4P23510 183 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 CLRN1P58418 232 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 MGAT2Q10469 447 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GRM1Q13255 1194 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SP140Q13342 867 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SLC10A5Q5PT55 438 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GALNT5Q7Z7M9 940 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 DPP9Q86TI2 863 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SLC35B2Q8TB61 432 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 STON2Q8WXE9 905 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ZBTB10Q96DT7 871 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 SORCS2Q96PQ0 1159 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AP1M1Q9BXS5 423 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 PCED1AQ9H1Q7 454 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM60Q9H2L4 133 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 LDAHQ9H6V9 325 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 ITM2CQ9NQX7 267 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 VPS45Q9NRW7 570 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM140Q9NV12 185 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 L1RE1Q9UN81 338 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 AKAP11Q9UKA4 1901 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 LEFTY2O00292 366 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRC-214ENST00000530727 GOLIM4O00461 696 aa4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms