RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523939.1

ALKAL1-202, Transcript of ALK and LTK ligand 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALKAL1, Length 536 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL1-202ENST00000523939 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 OBP2AQ9NY56 170 aa20.31■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 TJP2Q9UDY2 1190 aa20.31■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 A0A1W2PQH9 124 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 YJEFN3A6XGL0 299 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 E7ENQ6 273 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 PRAMEF12O95522 483 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 CASP14P31944 242 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 PSEN1P49768 467 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ZNF75DP51815 510 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 TAF3Q5VWG9 929 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 MTSS1LQ765P7 747 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 TMEM35BQ8NCS4 154 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 CLEC4CQ8WTT0 213 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 AGPAT1Q99943 283 aa20.3■□□□□ 0.84
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ALKAL1-202ENST00000523939 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
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ALKAL1-202ENST00000523939 E5RJQ4 531 aa20.29■□□□□ 0.84
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ALKAL1-202ENST00000523939 FBXO21O94952 628 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 FYNP06241 537 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 CCDC172P0C7W6 258 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 HDCP19113 662 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 VIPR2P41587 438 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 PTPN20Q4JDL3 420 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 HECTD3Q5T447 861 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 BEND5Q7L4P6 421 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 RIN3Q8TB24 985 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 DNAJC7Q99615 494 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 CCSER2Q9H7U1 834 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 CCL26Q9Y258 94 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 BDP1A6H8Y1 2624 aa20.29■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ASGR2P07307 311 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 LCP1P13796 627 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ARID5AQ03989 594 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 FCHO2Q0JRZ9 810 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 PTP4A2Q12974 167 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 TRIM14Q14142 442 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 TRIM72Q6ZMU5 477 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 HFE2Q6ZVN8 426 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ARHGAP18Q8N392 663 aa20.28■□□□□ 0.84
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ALKAL1-202ENST00000523939 E2F7Q96AV8 911 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 HAUS4Q9H6D7 363 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 TDP1Q9NUW8 608 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 TRIOO75962 3097 aa20.28■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 PIK3R2O00459 728 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 TLR5O60602 858 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ERBB2P04626 1255 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 RARGP13631 454 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 CENPCQ03188 943 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ASIC2Q16515 512 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 WDR59Q6PJI9 974 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 VITQ6UXI7 678 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 DRC7Q8IY82 874 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 KIAA1958Q8N8K9 716 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 CPLX3Q8WVH0 158 aa20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
ALKAL1-202ENST00000523939 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.27■□□□□ 0.84
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ALKAL1-202ENST00000523939 GREM1O60565 184 aa20.26■□□□□ 0.83
ALKAL1-202ENST00000523939 TBX18O95935 607 aa20.26■□□□□ 0.83
ALKAL1-202ENST00000523939 MMP8P22894 467 aa20.26■□□□□ 0.83
ALKAL1-202ENST00000523939 AVPR1AP37288 418 aa20.26■□□□□ 0.83
ALKAL1-202ENST00000523939 TDGQ13569 410 aa20.26■□□□□ 0.83
ALKAL1-202ENST00000523939 ZNF77Q15935 545 aa20.26■□□□□ 0.83
ALKAL1-202ENST00000523939 OLFML1Q6UWY5 402 aa20.26■□□□□ 0.83
ALKAL1-202ENST00000523939 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
ALKAL1-202ENST00000523939 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
ALKAL1-202ENST00000523939 CPA5Q8WXQ8 436 aa20.26■□□□□ 0.83
ALKAL1-202ENST00000523939 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
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