RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522968.1

UBXN8-205, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN8, Length 813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-205ENST00000522968 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
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UBXN8-205ENST00000522968 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
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