RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519760.1

CDK1-208, Transcript of cyclin dependent kinase 1, human

TSL 3

Gene CDK1, Length 276 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDK1-208	ENST00000519760	PIAS2	O75928	621 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	KLRC1	P26715	233 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	GATM	P50440	423 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	PGD	P52209	483 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	KRTAP10-9	P60411	292 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	ARHGEF7	Q14155	803 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	GRM3	Q14832	879 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	PPP2R5A	Q15172	486 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	RNF220	Q5VTB9	566 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM65	Q6PI78	240 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	ISM1	B1AKI9	464 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	BTBD19	C9JJ37	291 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	PROB1	E7EW31	1015 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	MYF5	P13349	255 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	PRF1	P14222	555 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	YY1	P25490	414 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	SLC14A1	Q13336	389 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	FHL3	Q13643	280 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	GALE	Q14376	348 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	SLC29A2	Q14542	456 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	SHC4	Q6S5L8	630 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	RANBP10	Q6VN20	620 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	USP49	Q70CQ1	688 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	UNC13D	Q70J99	1090 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	JDP2	Q8WYK2	163 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	COQ8B	Q96D53	544 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	KAZALD1	Q96I82	304 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	DKK4	Q9UBT3	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	VSTM5	A8MXK1	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760		F8W8V4	182 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760		H3BNC9	293 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	CLIC1	O00299	241 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TPP1	O14773	563 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	CCP110	O43303	1012 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	FRS3	O43559	492 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	CA12	O43570	354 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	MARCH6	O60337	910 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	ACVR2A	P27037	513 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	MTHFS	P49914	203 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	CPT1A	P50416	773 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	LINC00205	P59089	165 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	GHRHR	Q02643	423 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF91	Q05481	1191 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	FHL1	Q13642	323 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	NXN	Q6DKJ4	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	C14orf80	Q86SX3	495 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	APIP	Q96GX9	242 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		3.55	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760		M0R3H8	397 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TRIM38	O00635	465 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	FYB1	O15117	783 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	TSPAN6	O43657	245 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	PRAMEF2	O60811	474 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	FGB	P02675	491 aa		3.54	□□□□□ -1.84
CDK1-208	ENST00000519760	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84

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