RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517251.1

SCARNA20.6-201, small Cajal body-specific RNA 20, humanhuman

BASIC

Gene SCARNA20, Length 106 nt, Biotype scaRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PTGESO14684 152 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MCF2LO15068 1137 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CHADO15335 359 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 RASA4O43374 803 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 UGT1A9O60656 530 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SPAG7O75391 227 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 DAB1O75553 588 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 RECQL4O94761 1208 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 UNC5CO95185 931 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 KRT7P08729 469 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CYP2C8P10632 490 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 RBP3P10745 1247 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 VDRP11473 427 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 KRT3P12035 628 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CD19P15391 556 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 NQO1P15559 274 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TPSB2P20231 275 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 GPD1P21695 349 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TGM2P21980 687 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ATICP31939 592 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 L1CAMP32004 1257 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ARRB2P32121 409 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ADCY8P40145 1251 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ADCYAP1R1P41586 468 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MAGEA12P43365 314 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 IREB2P48200 963 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 BCAT1P54687 386 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 OSTNP61366 133 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 OCRLQ01968 901 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ROR1Q01973 937 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 LMNB2Q03252 620 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 GBE1Q04446 702 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 DNAJC3Q13217 504 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MTM1Q13496 603 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TUBB3Q13509 450 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SEMA5AQ13591 1074 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 DPYSQ14117 519 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TTLL4Q14679 1199 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ACAP1Q15027 740 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TPSAB1Q15661 275 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 GRIK4Q16099 956 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SOWAHAQ2M3V2 549 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 KIAA0319Q5VV43 1072 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 NUGGCQ68CJ6 796 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PMF1Q6P1K2 205 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MTHFD1LQ6UB35 978 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CAPN12Q6ZSI9 719 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CEP128Q6ZU80 1094 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CENPUQ71F23 418 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ARCQ7LC44 396 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TMEM110Q86TL2 294 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ERICH1Q86X53 443 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 NT5DC4Q86YG4 428 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ANKMY2Q8IV38 441 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PARP9Q8IXQ6 854 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ZBED8Q8IZ13 594 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 MPP5Q8N3R9 675 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 KIF2BQ8N4N8 673 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 CCDC185Q8N715 623 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 LRRC52Q8N7C0 313 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 C12orf29Q8N999 325 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 FAM71DQ8N9W8 422 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 TTC13Q8NBP0 860 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 RNF169Q8NCN4 708 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 FBXO36Q8NEA4 188 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 OR6Y1Q8NGX8 325 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 NPLOC4Q8TAT6 608 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 SLC7A14Q8TBB6 771 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ZNF398Q8TD17 642 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 FBF1Q8TES7 1133 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 AGAP11Q8TF27 550 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 RXFP2Q8WXD0 754 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 BRI3BPQ8WY22 251 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 NT5C3BQ969T7 300 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 ERP27Q96DN0 273 aa3.39□□□□□ -1.87
SCARNA20.6-201ENST00000517251 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms