RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517144.1

RNU6-232P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 232, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-232P, Length 64 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-232P-201ENST00000517144 C8orf58Q8NAV2 365 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 PNPLA8Q9NP80 782 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ASIC5Q9NY37 505 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CHPF2Q9P2E5 772 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 LPAR3Q9UBY5 353 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 WDR91A4D1P6 747 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 RHPN2P1A8MT19 583 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 TMPRSS11DO60235 418 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 IL18RAPO95256 599 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 KELP23276 732 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 DAG1Q14118 895 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 FAM187BQ17R55 369 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 MTX3Q5HYI7 312 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZNF626Q68DY1 528 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 RNF44Q7L0R7 432 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 C1QL2Q7Z5L3 287 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 GALNT16Q8N428 558 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 LINC01465Q8N7H1 131 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZDHHC12Q96GR4 267 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 C8orf48Q96LL4 319 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 C5orf34Q96MH7 638 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SLC29A3Q9BZD2 475 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 VPS51Q9UID3 782 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CORO2BQ9UQ03 480 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 A8MVJ9 347 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 THAP12O43422 761 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SNX2O60749 519 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 GCATO75600 419 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 MT-CO3P00414 261 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 APEHP13798 732 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CD19P15391 556 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 NTSR1P30989 418 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 PIK3CBP42338 1070 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZNF81P51508 661 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 COPB1P53618 953 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 C4orf46Q504U0 113 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 TMEM63BQ5T3F8 832 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 MANEALQ5VSG8 457 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 USP49Q70CQ1 688 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 IQCDQ96DY2 449 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SH2D3AQ9BRG2 576 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 TBC1D23Q9NUY8 699 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 STEAP1Q9UHE8 339 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 HPSEQ9Y251 543 aa4.94□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 RBL1P28749 1068 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 MCM5P33992 734 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZNF543Q08ER8 600 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CLCA4Q14CN2 919 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ST3GAL2Q16842 350 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 MORN5Q5VZ52 161 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CCDC17Q96LX7 622 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 FAM227BQ96M60 508 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ZNF778Q96MU6 729 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 RNF7Q9UBF6 113 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 BTBD3Q9Y2F9 522 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CLCA1A8K7I4 914 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 KIF3BO15066 747 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SLC5A1P13866 664 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 COPAP53621 1224 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 LRCH2Q5VUJ6 765 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 TMEM65Q6PI78 240 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CLEC9AQ6UXN8 241 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 KRT28Q7Z3Y7 464 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 ATP11CQ8NB49 1132 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 SARGQ9BW04 601 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 PDGFCQ9NRA1 345 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 WDR17Q8IZU2 1322 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 COL15A1P39059 1388 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU6-232P-201ENST00000517144 POM121BA6NF01 834 aa4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms