RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADAM23O75077 832 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TGFB1P01137 390 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 WEE2P0C1S8 567 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARP10275 920 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NR2F1P10589 423 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 HK1P19367 917 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRKCHP24723 683 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLRK1P26718 216 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBL1P28749 1068 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 EPHA3P29320 983 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 BSGP35613 385 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBA7P41226 1012 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MSH2P43246 934 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GSTM5P46439 218 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCP4P48539 62 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRAMEP78395 509 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZBED6P86452 979 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MC1RQ01726 317 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CREB5Q02930 508 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TAP2Q03519 686 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 DUSP8Q13202 625 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCNAB1Q14722 419 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GRM4Q14833 912 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CRYMQ14894 314 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CLCA4Q14CN2 919 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RASA2Q15283 850 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 P3H1Q32P28 736 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 NRN1LQ496H8 165 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ODF2Q5BJF6 829 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CBWD5Q5RIA9 395 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 DOK3Q7L591 496 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 LDHDQ86WU2 507 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 DTX1Q86Y01 620 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TP53INP2Q8IXH6 220 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC15A3Q8IY34 581 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PDPRQ8NCN5 879 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SSH3Q8TE77 659 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC22A17Q8WUG5 538 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TFAP2CQ92754 450 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRIB1Q96RU8 372 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TTYH3Q9C0H2 523 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ENKD1Q9H0I2 346 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM168Q9H0V1 697 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MUC13Q9H3R2 512 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RABEP2Q9H5N1 569 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CCDC134Q9H6E4 229 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 IL23AQ9NPF7 189 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 HCN3Q9P1Z3 774 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GIMAP2Q9UG22 337 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCND3Q9UK17 655 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACAD8Q9UKU7 415 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZMYM3Q14202 1370 aa3.37□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 H3BNC9 293 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 VPS4BO75351 444 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 TAF5LO75529 589 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 UBL4AP11441 157 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITGALP20701 1170 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 IL11P20809 199 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCNA3P22001 575 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 MMP8P22894 467 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPIFP30405 207 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC6A4P31645 630 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 ABCD1P33897 745 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GRK5P34947 590 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PNPLA4P41247 253 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GATMP50440 423 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 PGDP52209 483 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 DGKQP52824 942 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 SNX16P57768 344 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.36□□□□□ -1.87
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCNMA1Q12791 1236 aa3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms