RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 ST3GAL2Q16842 350 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 INSCQ1MX18 579 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PLA1AQ53H76 456 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF793Q6ZN11 406 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 USP43Q70EL4 1123 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR6B3Q8NGW1 331 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 MVB12AQ96EY5 273 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIM5Q9C035 493 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 MGAT4CQ9UBM8 478 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 INPPL1O15357 1258 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC28A2O43868 658 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC12A2P55011 1212 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 TIRAPP58753 221 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 FGL2Q14314 439 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 ODF1Q14990 250 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 LY6KQ17RY6 165 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 GIMAP6Q6P9H5 292 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF280BQ86YH2 543 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PNPLA1Q8N8W4 532 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 CTHRC1Q96CG8 243 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAP3K14Q99558 947 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 TUBB6Q9BUF5 446 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRIM54Q9BYV2 358 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 DPH1Q9BZG8 443 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 GJB4Q9NTQ9 266 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 DECR2Q9NUI1 292 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 PCDHA6Q9UN73 950 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-397P-201ENST00000516226 TNKSO95271 1327 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 A0A088AWK7 358 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRSS47A8MTI9 375 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 F8W810 466 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 CTIFO43310 598 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 MARCH6O60337 910 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 NGFRP08138 427 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 ARFIP2P53365 341 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 SEC23BQ15437 767 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF585BQ52M93 769 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 DGKKQ5KSL6 1271 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM57BQ71RH2 274 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 DENND1CQ8IV53 801 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC15A4Q8N697 577 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 NR4A3Q92570 626 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATP2A3Q93084 1043 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP2R3CQ969Q6 453 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 HSPBAP1Q96EW2 488 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRGPRX1Q96LB2 322 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPP1R9BQ96SB3 815 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 TCF7L1Q9HCS4 588 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 WNT16Q9UBV4 365 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDY1Q9Y6F8 540 aa2.71□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 VNN1O95497 513 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 IL33O95760 270 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 TNFRSF1BP20333 461 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 UQCRC1P31930 480 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 RAB1AP62820 205 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 EGR4Q05215 589 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 MFSD13AQ14CX5 517 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 RFX8Q6ZV50 586 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 IQCF1Q8N6M8 205 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC44A5Q8NCS7 719 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM171Q8WVE6 324 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC25A28Q96A46 364 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 WBP1Q96G27 269 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 P2RY11Q96G91 374 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 SUCLG2Q96I99 432 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF479Q96JC4 524 aa2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms