RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KLC2Q9H0B6 622 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CEP72Q9P209 647 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 FAM153AQ9UHL3 310 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MYH11P35749 1972 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 EFCAB6Q5THR3 1501 aa6.41□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CROCC2H7BZ55 1655 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV20A0A0B4J274 112 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PRR23AA6NEV1 266 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CFAP99D6REC4 459 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PGK2P07205 417 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CKBP12277 381 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HOXC12P31275 282 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HSD17B3P37058 310 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GP5P40197 560 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PAFAH1B1P43034 410 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CARSP49589 748 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 STARP49675 285 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RNF4P78317 190 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GCNT1Q02742 428 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.385e-6■■■■□ 19.6
PDE4D-216ENST00000507116 DUSP4Q13115 394 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 OXA1LQ15070 435 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CYP27C1Q4G0S4 372 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TPGS2Q68CL5 300 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ERAP2Q6P179 960 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CLYBLQ8N0X4 340 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TBATAQ96M53 351 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HINFPQ9BQA5 517 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SMYD3Q9H7B4 428 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 BRD7Q9NPI1 651 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 NDE1Q9NXR1 346 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TXNDC16Q9P2K2 825 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 A8MU76 341 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MFAP3LO75121 409 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PTPN4P29074 926 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TYK2P29597 1187 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GARSP41250 739 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MMP13P45452 471 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 AP1S2P56377 157 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 FOXK1P85037 733 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 CYP4F8P98187 520 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GALK2Q01415 458 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SGCGQ13326 291 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 IDI1Q13907 227 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GLYCTKQ8IVS8 523 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 OR6Y1Q8NGX8 325 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 FBXO30Q8TB52 745 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SSH1Q8WYL5 1049 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 SHC3Q92529 594 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PAGE5Q96GU1 130 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 EBF3Q9H4W6 596 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 C19orf44Q9H6X5 657 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 GDAP2Q9NXN4 497 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PDE4D-216ENST00000507116 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 SGK1O00141 431 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFS2O75306 463 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 CTNNA2P26232 953 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 KCNJ5P48544 419 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 SCNN1GP51170 649 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 BEX3Q00994 111 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 CDR2Q01850 454 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ZACNQ401N2 412 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 CEP55Q53EZ4 464 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 IFFO2Q5TF58 517 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 UGT2A3Q6UWM9 527 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.4□□□□□ -1.39
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF366Q8N895 744 aa6.4□□□□□ -1.39
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