RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TTC8	Q8TAM2	541 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ACD	Q96AP0	544 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP16	Q9BY84	665 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CYLD	Q9NQC7	956 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM12	Q9NTZ6	932 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB23	Q9ULC3	237 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		18.25	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	P4HA2	O15460	535 aa		18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	COCH	O43405	550 aa		18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TSSK4	Q6SA08	328 aa		18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZS52	159 aa		18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SYT13	Q7L8C5	426 aa		18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf29	Q8N999	325 aa		18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	THAP9	Q9H5L6	903 aa		18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	USP3	Q9Y6I4	520 aa		18.24	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ANAPC1	Q9H1A4	1944 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	HHLA1	C9JL84	531 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ADH1C	P00326	375 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ABL1	P00519	1130 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TPM2	P07951	284 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC130	P13994	396 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	PRKCSH	P14314	528 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	MTIF2	P46199	727 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF11	P52732	1056 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K7CL	P57077	242 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	DHCR24	Q15392	516 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR3D	Q70Z44	454 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SEMA4D	Q92854	862 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC35C1	Q96A29	364 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM176A	Q96HP8	235 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TWNK	Q96RR1	684 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	EBF1	Q9UH73	591 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		18.23	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	FRYL	O94915	3013 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	PALM2-AKAP2	B1ALY0	433 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	BEST1	O76090	585 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	RET	P07949	1114 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP5C1	P36542	298 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC8A3	P57103	927 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TYRO3	Q06418	890 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	LOXL4	Q96JB6	756 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CISH	Q9NSE2	258 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP97	Q9P2B7	532 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	NCDN	Q9UBB6	729 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		18.22	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	TLR5	O60602	858 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF40	O75150	1001 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	EGF	P01133	1207 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CYP17A1	P05093	508 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	OPRD1	P41143	372 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP8	P85298	464 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GAD2	Q05329	585 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GAB4	Q2WGN9	574 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	HEXIM2	Q96MH2	286 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	PNKP	Q96T60	521 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	HINFP	Q9BQA5	517 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GMIP	Q9P107	970 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		18.21	■□□□□ 0.51
HDAC10-216	ENST00000489424	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
HDAC10-216	ENST00000489424	CD58	P19256	250 aa		18.2	■□□□□ 0.5

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