RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487591.5

RRM2-208, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory subunit M2, human

TSL 2

Gene RRM2, Length 592 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2-208	ENST00000487591	MYH10	P35580	1976 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	KCNJ18	B7U540	433 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	LAD1	O00515	517 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	SNPH	O15079	494 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	COCH	O43405	550 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	ABL1	P00519	1130 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	GRIK1	P39086	918 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	MYL7	Q01449	175 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	MYO1E	Q12965	1108 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	SLC14A1	Q13336	389 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	PCSK4	Q6UW60	755 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	FSIP1	Q8NA03	581 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	TERB1	Q8NA31	727 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	SCAMP5	Q8TAC9	235 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	RAD54L	Q92698	747 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF560	Q96MR9	790 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	CHORDC1	Q9UHD1	332 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	MYLK	Q15746	1914 aa		9.25	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591		A0A087WV48	116 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	KCNK3	O14649	394 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	TRIM66	O15016	1216 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	IL18RAP	O95256	599 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	ADH1C	P00326	375 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	KRT19	P08727	400 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	CISD3	P0C7P0	127 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	NTSR1	P30989	418 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	PNPLA4	P41247	253 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	CYP27A1	Q02318	531 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	VSTM1	Q6UX27	236 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	DYM	Q7RTS9	669 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	ZCCHC9	Q8N567	271 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	KCNK16	Q96T55	309 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	KIF2C	Q99661	725 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	GABRG3	Q99928	467 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	DKK4	Q9UBT3	224 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	CDH9	Q9ULB4	789 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	CKAP5	Q14008	2032 aa		9.24	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	E2F8	A0AVK6	867 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	CILP	O75339	1184 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	TBX18	O95935	607 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	SYP	P08247	313 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	IRF1	P10914	325 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	PLA2G2A	P14555	144 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	PFKL	P17858	780 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	PCSK1	P29120	753 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	DDIT3	P35638	169 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	DPP6	P42658	865 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	LHX1	P48742	406 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	GAD2	Q05329	585 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	HNRNPD	Q14103	355 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	LAYN	Q6UX15	382 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		9.23	□□□□□ -0.93
RRM2-208	ENST00000487591	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		9.23	□□□□□ -0.93

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms