RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484528.1

USP40-215, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 933 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-215ENST00000484528 LY6G5CQ5SRR4 150 aa22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 TTC30AQ86WT1 665 aa22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 NACA2Q9H009 215 aa22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa22.81■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 E2F8A0AVK6 867 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 FAM92AA1XBS5 289 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 SLC30A4O14863 429 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 FAM200BP0CF97 657 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ADAM9Q13443 819 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 NFIL3Q16649 462 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 PLK5Q496M5 336 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 SNX30Q5VWJ9 437 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ANO7Q6IWH7 933 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 BBS7Q8IWZ6 715 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 KIAA1958Q8N8K9 716 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 PNKPQ96T60 521 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 TBC1D14Q9P2M4 693 aa22.8■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 TLR5O60602 858 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 KAT7O95251 611 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 TUBP50607 506 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 INCA1Q0VD86 236 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ALLCQ8N6M5 410 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 NAT16Q8N8M0 369 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 CCDC26Q8TAB7 109 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 LOXL4Q96JB6 756 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 NIF3L1Q9GZT8 377 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ARHGEF4Q9NR80 690 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 COMMD8Q9NX08 183 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 EBF1Q9UH73 591 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 MMP17Q9ULZ9 603 aa22.79■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ACACBO00763 2458 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 CYP26A1O43174 497 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 TBX18O95935 607 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 APODP05090 189 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 GBP1P32455 592 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 TIE1P35590 1138 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 MPLP40238 635 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 PNOCQ13519 176 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 EMC10Q5UCC4 262 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 WHAMMQ8TF30 809 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 NT5C1AQ9BXI3 368 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.78■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 KCNA4P22459 653 aa22.77■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ELF2Q15723 593 aa22.77■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 ZNF394Q53GI3 561 aa22.77■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 TMEM92Q6UXU6 159 aa22.77■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 CYP3A43Q9HB55 503 aa22.77■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 OSER1Q9NX31 292 aa22.77■■□□□ 1.24
USP40-215ENST00000484528 HHLA1C9JL84 531 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 SGK1O00141 431 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 MDM4O15151 490 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 CILPO75339 1184 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 ZNF806P0C7X5 589 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 ACO1P21399 889 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 GAD2Q05329 585 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 CRY1Q16526 586 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 ANO4Q32M45 955 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 TCEAL6Q6IPX3 200 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 TMEM25Q86YD3 366 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 IL17RCQ8NAC3 791 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 CCDC150Q8NCX0 1101 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 MDGA1Q8NFP4 955 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 SEMA4DQ92854 862 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 TCEAL3Q969E4 200 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 OTUB2Q96DC9 234 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 TMEM8AQ9HCN3 771 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 SPHK2Q9NRA0 654 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.76■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 GRIA2P42262 883 aa22.75■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 CREB5Q02930 508 aa22.75■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 PPM1JQ5JR12 505 aa22.75■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.75■■□□□ 1.23
USP40-215ENST00000484528 BTBD8Q5XKL5 378 aa22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms